141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3358 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  100 
 
 
547 aa  1080    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  74.77 
 
 
549 aa  781    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  50.18 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  46.07 
 
 
549 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  50.79 
 
 
515 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  44.04 
 
 
536 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  49.91 
 
 
572 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  47.42 
 
 
508 aa  360  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  47.35 
 
 
508 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  42.57 
 
 
522 aa  330  3e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  42.33 
 
 
525 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  40.41 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  39.39 
 
 
496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  38.13 
 
 
480 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  37.64 
 
 
494 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  38.31 
 
 
484 aa  263  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  37.85 
 
 
498 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  37.5 
 
 
490 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  35.59 
 
 
498 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  39.87 
 
 
505 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  35.53 
 
 
509 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  36.3 
 
 
502 aa  239  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  37.08 
 
 
507 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  37.08 
 
 
507 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  36.9 
 
 
507 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  36.9 
 
 
514 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  38.46 
 
 
498 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  37.65 
 
 
494 aa  231  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  37.45 
 
 
494 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  35.45 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  35.93 
 
 
481 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  26.36 
 
 
201 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  42.5 
 
 
288 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  38.35 
 
 
307 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.44 
 
 
286 aa  60.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  36.57 
 
 
376 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  43.68 
 
 
270 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  34.97 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  30.73 
 
 
317 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  40.45 
 
 
372 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  31.41 
 
 
317 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.64 
 
 
293 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  44.44 
 
 
363 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  36.88 
 
 
231 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  27.39 
 
 
202 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  27.72 
 
 
200 aa  53.9  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  32.48 
 
 
278 aa  53.5  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  29.84 
 
 
324 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.41 
 
 
317 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  36.25 
 
 
286 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
279 aa  52  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.71 
 
 
293 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  26.75 
 
 
202 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  34.62 
 
 
277 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.59 
 
 
340 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  46.51 
 
 
295 aa  51.6  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  26.73 
 
 
200 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  29.27 
 
 
200 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.62 
 
 
286 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  26.11 
 
 
202 aa  51.2  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.52 
 
 
303 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  32.41 
 
 
281 aa  51.2  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  35.04 
 
 
276 aa  50.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  27.98 
 
 
317 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  34.52 
 
 
286 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  28.91 
 
 
262 aa  50.8  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  25.83 
 
 
210 aa  50.4  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  30.77 
 
 
284 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  41.24 
 
 
284 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  34.75 
 
 
283 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  25.83 
 
 
210 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  34.62 
 
 
289 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  35.64 
 
 
227 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01259  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.66 
 
 
308 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  27.98 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  25.5 
 
 
202 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  35.34 
 
 
414 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  37.7 
 
 
345 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0303  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.12 
 
 
340 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
276 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50510  predicted protein  27.91 
 
 
647 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  37.21 
 
 
231 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  37.21 
 
 
231 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.14 
 
 
276 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  29.38 
 
 
285 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3777  hypothetical protein  25.85 
 
 
279 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165446 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  26.83 
 
 
198 aa  47.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  24.2 
 
 
208 aa  47.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  32.39 
 
 
280 aa  47.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  38.2 
 
 
303 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  38.2 
 
 
303 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0650  hypothetical protein  25.33 
 
 
268 aa  47  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.348415  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 
330 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.97 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  34.03 
 
 
280 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  35.82 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  31.87 
 
 
274 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.14 
 
 
276 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.83 
 
 
340 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  31.62 
 
 
382 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>