More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5079 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  100 
 
 
481 aa  951    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  50.21 
 
 
494 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  50.62 
 
 
494 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  41.91 
 
 
498 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  39.35 
 
 
509 aa  296  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  38.59 
 
 
502 aa  256  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  38.84 
 
 
498 aa  253  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  37.9 
 
 
505 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  35.29 
 
 
496 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  38.36 
 
 
498 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  38.75 
 
 
514 aa  246  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  36.44 
 
 
507 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  36.44 
 
 
507 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  36.01 
 
 
480 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  38.68 
 
 
494 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  37.34 
 
 
507 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  35.94 
 
 
484 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  34.1 
 
 
490 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  34.37 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  35.9 
 
 
494 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  34.43 
 
 
549 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  35.62 
 
 
522 aa  207  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  38.89 
 
 
508 aa  200  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  38.83 
 
 
572 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  34 
 
 
536 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  35.93 
 
 
547 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  36.84 
 
 
558 aa  180  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  34.81 
 
 
515 aa  180  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  38.02 
 
 
508 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  34.53 
 
 
549 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  34.96 
 
 
525 aa  156  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.41 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  37.57 
 
 
223 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.84 
 
 
286 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  33.6 
 
 
210 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  36 
 
 
285 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  33.76 
 
 
363 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  32.52 
 
 
231 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36 
 
 
285 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  31.49 
 
 
284 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  52.05 
 
 
283 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  32.8 
 
 
210 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  29.86 
 
 
206 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  37.9 
 
 
218 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.84 
 
 
285 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  27.21 
 
 
262 aa  60.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  35.37 
 
 
286 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  36.42 
 
 
324 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  35.77 
 
 
284 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  40.71 
 
 
382 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  42.47 
 
 
271 aa  59.7  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  36.43 
 
 
277 aa  60.1  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  26.96 
 
 
200 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.76 
 
 
293 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  41.59 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  36.49 
 
 
288 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.45 
 
 
300 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  26.45 
 
 
200 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.69 
 
 
286 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  27.93 
 
 
281 aa  57.4  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  26.45 
 
 
200 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  39.47 
 
 
359 aa  57.4  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  27.66 
 
 
235 aa  57  0.0000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  33.33 
 
 
201 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  29.85 
 
 
315 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  30.83 
 
 
285 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  40.71 
 
 
386 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0637  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.06 
 
 
308 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.408193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  38.02 
 
 
289 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  33.91 
 
 
283 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  33.06 
 
 
288 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  43.42 
 
 
288 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.89 
 
 
275 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  38.36 
 
 
262 aa  56.6  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.58 
 
 
317 aa  56.6  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  32.41 
 
 
236 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  39.52 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.34 
 
 
342 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  31.3 
 
 
330 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  32.5 
 
 
198 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.11 
 
 
276 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.33 
 
 
293 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.34 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.11 
 
 
276 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.34 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.34 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.34 
 
 
342 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  28.99 
 
 
285 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  29.61 
 
 
285 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  44.59 
 
 
280 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  30.99 
 
 
317 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.1 
 
 
270 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  43.21 
 
 
372 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  36.51 
 
 
275 aa  54.3  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  32.81 
 
 
317 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  34.93 
 
 
275 aa  54.3  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.11 
 
 
276 aa  53.9  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  35.34 
 
 
321 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  30.43 
 
 
324 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.58 
 
 
299 aa  53.5  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>