More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2204 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  100 
 
 		 536 aa  1070    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  50.92 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  53.7 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  52.98 
 
 		 572 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  49.61 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  51.17 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  47.52 
 
 		 525 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  47.8 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  43.93 
 
 		 547 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  43.2 
 
 		 549 aa  369  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  41.6 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  39.81 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  39.44 
 
 		 558 aa  296  8e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  38.6 
 
 		 496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  38.22 
 
 		 494 aa  276  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  37.77 
 
 		 480 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  36.83 
 
 		 490 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  36.53 
 
 		 498 aa  259  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  36.33 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  36.33 
 
 		 507 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  37.33 
 
 		 505 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  36.2 
 
 		 502 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  35.05 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  35.7 
 
 		 498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  35.95 
 
 		 507 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  35.03 
 
 		 514 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  35.52 
 
 		 494 aa  226  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  35.29 
 
 		 498 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  35.38 
 
 		 494 aa  203  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  34 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  32.72 
 
 		 494 aa  189  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  40.58 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  29.77 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.59 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  37.96 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.1 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  34.78 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  40.5 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.81 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  33.91 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.94 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  31.08 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  37.11 
 
 		 206 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  37.19 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  35.38 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.46 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.4 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  30.34 
 
 		 208 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.68 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.52 
 
 		 280 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  36.8 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  32.39 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.88 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  42.86 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  29.73 
 
 		 202 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.28 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  40.87 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  36.8 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  45.98 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  43.24 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  30.64 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  39.06 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  24.07 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  35.71 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50510  predicted protein  25.16 
 
 		 647 aa  63.9  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  31.88 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.38 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  31.86 
 
 		 177 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  26.43 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  38.82 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.24 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  39.32 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.48 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  40.17 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  40.17 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  37.9 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  35.61 
 
 		 277 aa  62  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  34.52 
 
 		 198 aa  62  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  36.13 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  31.66 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.62 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.62 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.62 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  37.62 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.62 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.92 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  43.21 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  33.33 
 
 		 296 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  43.75 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.62 
 
 		 343 aa  60.1  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.62 
 
 		 343 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.5 
 
 		 284 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  31.5 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.62 
 
 		 343 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.62 
 
 		 343 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>