More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1468 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  93.72 
 
 		 494 aa  878    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  100 
 
 		 494 aa  973    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  50.21 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  46.23 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  44.01 
 
 		 509 aa  349  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  45.59 
 
 		 498 aa  342  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  41.01 
 
 		 496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  43.7 
 
 		 502 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  44.11 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  43.86 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  43.86 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  43.86 
 
 		 507 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  42.34 
 
 		 514 aa  313  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  42.27 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  40.91 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  39.92 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  39.41 
 
 		 549 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  40.77 
 
 		 522 aa  273  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  39.1 
 
 		 494 aa  273  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  40.28 
 
 		 498 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  38.16 
 
 		 486 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  39.67 
 
 		 494 aa  253  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  39.64 
 
 		 508 aa  246  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  40.56 
 
 		 508 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  35.52 
 
 		 536 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  39.42 
 
 		 572 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  37.65 
 
 		 547 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  37.76 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  38.43 
 
 		 525 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  39.5 
 
 		 549 aa  216  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  41.44 
 
 		 558 aa  203  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.12 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  32.37 
 
 		 315 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.99 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  30.37 
 
 		 210 aa  66.6  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  42.67 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  35.07 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  29.03 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  49.32 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  35.38 
 
 		 316 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  35.14 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  35.38 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  33.9 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  29.95 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  29.36 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  31.73 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  28.72 
 
 		 201 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  34.88 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  23.7 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  39.69 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  22.63 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.37 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  36.26 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  22.96 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.26 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  41.77 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  42.62 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  40.15 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.8 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  28.05 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.09 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40.34 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  27.5 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  37.32 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  39.73 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.25 
 
 		 302 aa  57  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  31.43 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.12 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.94 
 
 		 277 aa  56.6  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  38.71 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.39 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  35.56 
 
 		 288 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2470  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.86 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112991  hitchhiker  0.0000511944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  52.05 
 
 		 274 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.16 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  52 
 
 		 283 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0637  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.31 
 
 		 308 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.408193  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.39 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.3 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1270  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.84 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.39 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.39 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  35.66 
 
 		 236 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  37.6 
 
 		 218 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  30.41 
 
 		 288 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  40.45 
 
 		 275 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.39 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  32.84 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  45.95 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  27.33 
 
 		 206 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  43.42 
 
 		 275 aa  55.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  24.74 
 
 		 198 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  33.96 
 
 		 231 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  44.44 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  42.67 
 
 		 288 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  29.71 
 
 		 317 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42 
 
 		 293 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  36.56 
 
 		 286 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  30.66 
 
 		 343 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>