More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4912 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  100 
 
 
324 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  68.57 
 
 
341 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  67.83 
 
 
340 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  67.83 
 
 
341 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  71.24 
 
 
315 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  53.72 
 
 
317 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  52.79 
 
 
317 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  51.63 
 
 
317 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  51.3 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  52.36 
 
 
322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  49.04 
 
 
324 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  50.79 
 
 
315 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  50.81 
 
 
317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  50.49 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  50.32 
 
 
316 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  52.1 
 
 
318 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  49.39 
 
 
461 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  37.21 
 
 
494 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  38.89 
 
 
480 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  37.16 
 
 
490 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  39.88 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  32.19 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.86 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  33.92 
 
 
498 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.65 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  42.11 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  42.11 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.23 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.5 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  41.33 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.74 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  36.65 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  37.65 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  33.1 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  33.1 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  37.25 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  26.29 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  35.26 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  30.61 
 
 
210 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1870  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.09 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  36.77 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  28.27 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  39.58 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  39.39 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  29.93 
 
 
210 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  34.31 
 
 
227 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.39 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  25.64 
 
 
202 aa  67  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  38.41 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  38.41 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.92 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.85 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  33.56 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.67 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  36.42 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2351  modification methylase, HemK family  34.34 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  31.02 
 
 
496 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.2 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  37.89 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  48.72 
 
 
202 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  41.77 
 
 
278 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  31.45 
 
 
288 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  27.54 
 
 
206 aa  63.5  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  38.96 
 
 
235 aa  63.9  0.000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  36.15 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  27.03 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4140  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.14 
 
 
345 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.449195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1427  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  33.33 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  36.84 
 
 
274 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  29.45 
 
 
211 aa  63.2  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.32 
 
 
293 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  29.05 
 
 
202 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  33.33 
 
 
284 aa  62.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  25.56 
 
 
201 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  39.01 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.87 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02255  N5-glutamine methyltransferase  31.52 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1326  modification methylase, HemK family  31.52 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.695473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2487  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.52 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0920216  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.21 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2625  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.52 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  34.09 
 
 
507 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  33.84 
 
 
514 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.72 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  38.46 
 
 
199 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  36.42 
 
 
287 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2482  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.52 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02215  hypothetical protein  31.52 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  45.95 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.22 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.13 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  34.25 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1322  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.52 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3471  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.52 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1415  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.03 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.270918  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1480  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.03 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.760634  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  41.77 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.03 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2708  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.52 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  36.49 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>