More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0182 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  70.79 
 
 		 202 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  70.79 
 
 		 202 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  52.26 
 
 		 202 aa  214  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  53.27 
 
 		 200 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  50.75 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  48.74 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  45.77 
 
 		 196 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  48.74 
 
 		 199 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  49.75 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  49.75 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  48.74 
 
 		 199 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  44.78 
 
 		 201 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  49.25 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  49.25 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  48.47 
 
 		 217 aa  177  7e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  49.25 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  49.25 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  49.25 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  48.99 
 
 		 196 aa  175  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  43.94 
 
 		 227 aa  174  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  45.45 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  38.92 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  39.8 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  37.75 
 
 		 201 aa  148  7e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  37.44 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  37.31 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  38.81 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  36.82 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  36 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  36.87 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  38 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  30.09 
 
 		 223 aa  121  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.66 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  30.81 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  34.13 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  32.31 
 
 		 228 aa  117  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.65 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  32.68 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  32.34 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  28.71 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  28.37 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  31.47 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  30.69 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  26.39 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  31.53 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  31.84 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  32.67 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  32.51 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  28.14 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  33 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  29.3 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  28.22 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.39 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  34.25 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  30.15 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  31.11 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  30.34 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  34.25 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  33.33 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  30.56 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  25.76 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  26.32 
 
 		 227 aa  92  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2937  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.15 
 
 		 383 aa  92  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2296  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.41 
 
 		 382 aa  92  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0790  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.79 
 
 		 374 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.960699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0447  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31 
 
 		 384 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.389747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0934  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.35 
 
 		 402 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3266  methyltransferase family protein  27.86 
 
 		 378 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3551  methyltransferase family protein  27.86 
 
 		 378 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.715445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3489  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.8 
 
 		 384 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  28.11 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0751  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.69 
 
 		 377 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  27.84 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02953  predicted methyltransferase small domain protein  27.36 
 
 		 378 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.932985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0617  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.36 
 
 		 378 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02903  hypothetical protein  27.36 
 
 		 378 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0616  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.36 
 
 		 378 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4398  methyltransferase family protein  27.36 
 
 		 378 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3376  methyltransferase family protein  27.94 
 
 		 378 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  29.61 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3444  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.86 
 
 		 378 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0151  hypothetical protein  29.08 
 
 		 340 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4648  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.85 
 
 		 374 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.86 
 
 		 378 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0918  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.86 
 
 		 378 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3372  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.5 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3107  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.92 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4140  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.84 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.449195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2886  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3380  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.37 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4510  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.85 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3520  methyltransferase family protein  26.87 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4642  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.85 
 
 		 374 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  28.72 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0968  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.93 
 
 		 377 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0500  methyltransferase family protein  28.35 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0562  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.35 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1094  methyltransferase family protein  28.35 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2548  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.64 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>