More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2509 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  100 
 
 		 317 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  96.52 
 
 		 316 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  77.22 
 
 		 317 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  78.41 
 
 		 317 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  61.71 
 
 		 317 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  56.9 
 
 		 322 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  55.34 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  56.44 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  55.66 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  51.4 
 
 		 341 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  51.58 
 
 		 340 aa  299  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  51.58 
 
 		 341 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  50.81 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  49.19 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  54.72 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  52.79 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  55.27 
 
 		 461 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1870  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.53 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  38.6 
 
 		 498 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  35.66 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  31.08 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  31.97 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  30.14 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  38.36 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2594  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  31.97 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2252  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.09 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  34.51 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  34.13 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  32.74 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  32.81 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  36.8 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.03 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  35.48 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2223  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.34 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  30.54 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  35.65 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.5 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  39.56 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.83 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1017  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.07 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  30.08 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  33.06 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1546  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.09 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  40.43 
 
 		 494 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.46 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2092  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.71 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  28.87 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  32.45 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1427  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  30.57 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  35.11 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.01 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  39.58 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2977  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.57 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  35.2 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  37.76 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  38.95 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.81 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  38.54 
 
 		 536 aa  57  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.18 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.87 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1322  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.64 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2470  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.26 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112991  hitchhiker  0.0000511944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  42.05 
 
 		 549 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  34.12 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01259  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.59 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.61 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3164  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.41 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  36.51 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  31.14 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  32.88 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.94 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.92 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.37 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02255  N5-glutamine methyltransferase  36.03 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02215  hypothetical protein  36.03 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.17 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.06 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1326  modification methylase, HemK family  36.03 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.695473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  27.78 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2487  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.03 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0920216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  31.09 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3471  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.03 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  42.67 
 
 		 202 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.98 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  26.8 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  36.84 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2708  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.03 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  34.59 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2482  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.03 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  28.79 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2625  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.03 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0866  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  41.1 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1460  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.59 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  26.54 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>