281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  100 
 
 		 549 aa  1062    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  66.67 
 
 		 572 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  59.59 
 
 		 515 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  59.85 
 
 		 508 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  55.54 
 
 		 508 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  50.92 
 
 		 536 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  47.95 
 
 		 522 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  50.37 
 
 		 525 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  45.8 
 
 		 547 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  44.25 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  40.93 
 
 		 496 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  43.57 
 
 		 558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  40.64 
 
 		 486 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  40.45 
 
 		 480 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  39.47 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  40.15 
 
 		 494 aa  295  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  39.39 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  40.07 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  39.41 
 
 		 494 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  38.35 
 
 		 507 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  38.35 
 
 		 507 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  38.5 
 
 		 507 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  37.23 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  38.1 
 
 		 514 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  37.38 
 
 		 505 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  39.03 
 
 		 494 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  36.13 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  36.31 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  40.3 
 
 		 498 aa  236  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  34.43 
 
 		 481 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  36.95 
 
 		 494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  37.24 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.86 
 
 		 307 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.29 
 
 		 288 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  36.12 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  31.85 
 
 		 210 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.07 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  34.31 
 
 		 262 aa  67  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.07 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  33.33 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.06 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.5 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  30.37 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.53 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.88 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.85 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  39.04 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  41.35 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  35.34 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  34.09 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.11 
 
 		 314 aa  60.1  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  34.72 
 
 		 236 aa  60.1  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.44 
 
 		 286 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  34.67 
 
 		 206 aa  60.1  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  32.38 
 
 		 324 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.56 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  26.49 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.88 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  36.81 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  34.44 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  47.06 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  38.81 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  38.16 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  27.15 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  42.7 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.16 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  28.25 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  32.39 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  45.95 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  45.95 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  31.5 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  42.7 
 
 		 317 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  42.05 
 
 		 317 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1673  HemK family modification methylase  39.24 
 
 		 268 aa  57  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0452249  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  41.18 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  41.89 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  42.86 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  38.67 
 
 		 271 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  36.08 
 
 		 322 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  43.68 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  34.25 
 
 		 289 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.24 
 
 		 299 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 287 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.89 
 
 		 304 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  40.26 
 
 		 359 aa  55.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.45 
 
 		 289 aa  54.7  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  41.49 
 
 		 317 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.63 
 
 		 367 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  41.18 
 
 		 277 aa  54.7  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.73 
 
 		 340 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.68 
 
 		 283 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  25.83 
 
 		 202 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  43.24 
 
 		 227 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  32.98 
 
 		 287 aa  54.3  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  25.83 
 
 		 202 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  26.92 
 
 		 201 aa  53.9  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  38.14 
 
 		 276 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  35.11 
 
 		 278 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>