259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1495 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  68.36 
 
 		 498 aa  655    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  100 
 
 		 498 aa  971    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  47.49 
 
 		 509 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  45.59 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  45.38 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  45.81 
 
 		 494 aa  359  5e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  45.06 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  44.26 
 
 		 514 aa  323  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  43.65 
 
 		 502 aa  322  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  39.48 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  41.63 
 
 		 507 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  41.95 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  41.95 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  38.84 
 
 		 481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  40.41 
 
 		 484 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  39.71 
 
 		 522 aa  266  7e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  40.04 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  40.35 
 
 		 508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  35.26 
 
 		 549 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  38.71 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  39.76 
 
 		 515 aa  249  9e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  42.89 
 
 		 494 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  37.78 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  35.29 
 
 		 536 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  40.34 
 
 		 498 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  38.46 
 
 		 547 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  38.46 
 
 		 549 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  38.68 
 
 		 572 aa  236  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  42.25 
 
 		 508 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  40.78 
 
 		 558 aa  221  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  39.2 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.01 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  39.76 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  29.67 
 
 		 201 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  33.6 
 
 		 210 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.47 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.37 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  29.26 
 
 		 286 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  24.34 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  32 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  31.4 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  37.82 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  37.5 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.01 
 
 		 202 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  35.15 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  34.17 
 
 		 284 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.22 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  39.19 
 
 		 270 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  30.22 
 
 		 283 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.91 
 
 		 289 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  33.61 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.18 
 
 		 285 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0303  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.23 
 
 		 340 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  32.79 
 
 		 282 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.68 
 
 		 202 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  34.18 
 
 		 285 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  26.97 
 
 		 262 aa  54.3  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  42.86 
 
 		 282 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  42.86 
 
 		 282 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  37.36 
 
 		 283 aa  54.3  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  26.23 
 
 		 235 aa  53.9  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  27.91 
 
 		 202 aa  53.9  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.1 
 
 		 276 aa  53.9  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  29.95 
 
 		 363 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  28.91 
 
 		 287 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  43.24 
 
 		 277 aa  53.9  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.38 
 
 		 277 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.38 
 
 		 277 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.38 
 
 		 277 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.38 
 
 		 277 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 		 322 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  38.17 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  31.67 
 
 		 284 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.24 
 
 		 343 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 282 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.65 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.48 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.48 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2857  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 		 309 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  31.06 
 
 		 277 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  29.07 
 
 		 198 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.48 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  24.56 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.48 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  38.96 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  28.21 
 
 		 200 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  32.48 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.48 
 
 		 343 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.23 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  37.33 
 
 		 359 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  25.88 
 
 		 200 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0840  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.09 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  41.56 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3507  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.09 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.48 
 
 		 343 aa  52  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  32.5 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.48 
 
 		 343 aa  52  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3636  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.09 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  31.52 
 
 		 303 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  31.52 
 
 		 303 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>