More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3521 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  100 
 
 		 490 aa  951    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  68.38 
 
 		 480 aa  626  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  59.5 
 
 		 494 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  57.03 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  54.58 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  46.87 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  45.64 
 
 		 486 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  43.93 
 
 		 522 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  39.47 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  43.44 
 
 		 515 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  39.92 
 
 		 494 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  42.92 
 
 		 509 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  40.28 
 
 		 572 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  36.83 
 
 		 536 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  43.49 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  40.67 
 
 		 508 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  39.72 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  38.92 
 
 		 498 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  40.44 
 
 		 505 aa  246  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  37.48 
 
 		 547 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  40.35 
 
 		 514 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  40.83 
 
 		 507 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  40.83 
 
 		 507 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  40.62 
 
 		 507 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  40.88 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  40.96 
 
 		 502 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  35.18 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  34.1 
 
 		 481 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  36.08 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  38.16 
 
 		 494 aa  200  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  33.52 
 
 		 558 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  37.16 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  35.32 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  34.47 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  38.67 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  36.07 
 
 		 281 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  37.82 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  41.58 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  35.82 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  37.7 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  31.85 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  35.77 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  39.16 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.59 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.06 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  34.57 
 
 		 340 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.51 
 
 		 288 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.75 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  39.56 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  37.5 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  36.61 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  39.56 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  29.76 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50510  predicted protein  29.54 
 
 		 647 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  33.95 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  30.86 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.68 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  35.71 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  32.62 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  34.17 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  32.62 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  38.16 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  26.35 
 
 		 262 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2013  methyltransferase small  37.16 
 
 		 331 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.71 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  36.67 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.68 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  33.77 
 
 		 201 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  32.74 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  33.95 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  33.33 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  32.39 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.45 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  33.78 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  43.24 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  33.78 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.17 
 
 		 280 aa  57  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.19 
 
 		 276 aa  57  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  32.43 
 
 		 198 aa  57  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 323 aa  57  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  33.88 
 
 		 275 aa  57  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  57  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  39.52 
 
 		 284 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.61 
 
 		 285 aa  56.6  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  34.97 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  28.99 
 
 		 206 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  35.77 
 
 		 374 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  36.36 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  33.11 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  28.15 
 
 		 202 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.4 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.68 
 
 		 303 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  33.99 
 
 		 204 aa  54.7  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  31.58 
 
 		 284 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  27.21 
 
 		 322 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.1 
 
 		 202 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  27.4 
 
 		 278 aa  53.9  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 327 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>