39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2013 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2013  methyltransferase small  100 
 
 		 331 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  33.33 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  37.16 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  36.84 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  28.79 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  34.81 
 
 		 372 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  33.91 
 
 		 522 aa  52.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  27.18 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  34.51 
 
 		 480 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  26.56 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  37.16 
 
 		 484 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  32.24 
 
 		 496 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  30.56 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  36.43 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  29.63 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  26.6 
 
 		 324 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  30.16 
 
 		 508 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  32.68 
 
 		 498 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  28.86 
 
 		 202 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  29.71 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  33.97 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  26.85 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  34.71 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  37.97 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  31.76 
 
 		 494 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  34.88 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  36.64 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  34.57 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  42.68 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  33.58 
 
 		 188 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  29.66 
 
 		 549 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  32.21 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  28.57 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  41.77 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  31.02 
 
 		 481 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  43.37 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  29.53 
 
 		 322 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>