More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1957 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  100 
 
 
188 aa  367  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  62.01 
 
 
185 aa  218  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  58.7 
 
 
193 aa  207  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  61.02 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  53.85 
 
 
185 aa  187  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  47.54 
 
 
202 aa  165  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  54.27 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  49.43 
 
 
208 aa  150  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  47.78 
 
 
204 aa  150  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  46.94 
 
 
202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  54.49 
 
 
199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  51.65 
 
 
193 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  48.37 
 
 
202 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  40.12 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  40.72 
 
 
202 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  41.82 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  38.92 
 
 
202 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  38.32 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  36.13 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  33.97 
 
 
226 aa  87.8  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  29.02 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  30.69 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  36.63 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  29.22 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  38.51 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  40.41 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  37.78 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  27.07 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  31.17 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  32.95 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.11 
 
 
288 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  35.48 
 
 
378 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  33.9 
 
 
235 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  44.95 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  44.95 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.84 
 
 
287 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  34.64 
 
 
230 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  30.98 
 
 
404 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  34.04 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.68 
 
 
286 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  27.13 
 
 
262 aa  60.1  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.57 
 
 
286 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  34.08 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1394  hypothetical protein  40.21 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.41 
 
 
279 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  37.84 
 
 
288 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  36.26 
 
 
285 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  33.63 
 
 
262 aa  57.8  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4861  modification methylase, HemK family  32.79 
 
 
276 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.707131  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  35.67 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2602  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.87 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  32.18 
 
 
284 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  35.93 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5532  predicted protein  31.89 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  27.57 
 
 
400 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  39.45 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0257  HemK family modification methylase  33.54 
 
 
313 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  34.38 
 
 
376 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  32.71 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  37.4 
 
 
317 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  27.47 
 
 
286 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.09 
 
 
307 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  34.88 
 
 
249 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  35.43 
 
 
341 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  34.19 
 
 
288 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  35.92 
 
 
359 aa  55.1  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  33.94 
 
 
317 aa  55.1  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  29.79 
 
 
275 aa  55.5  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  35.66 
 
 
287 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  33.55 
 
 
299 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  35.57 
 
 
311 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.19 
 
 
277 aa  54.7  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  29.59 
 
 
283 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  33.03 
 
 
278 aa  54.3  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.59 
 
 
283 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.56 
 
 
289 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  34.01 
 
 
536 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  36.62 
 
 
392 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  32.95 
 
 
258 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  32.93 
 
 
397 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.4 
 
 
333 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  30.32 
 
 
324 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  34.52 
 
 
280 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  34.44 
 
 
386 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  29.23 
 
 
267 aa  53.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  32.9 
 
 
287 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  38.52 
 
 
317 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  33.77 
 
 
382 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  34.5 
 
 
276 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  35.66 
 
 
340 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  25 
 
 
280 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  28.39 
 
 
276 aa  52  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  29.35 
 
 
404 aa  52  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  32.76 
 
 
270 aa  51.6  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.92 
 
 
314 aa  51.6  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  44.74 
 
 
317 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  33.77 
 
 
382 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  34.87 
 
 
298 aa  51.2  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  31.41 
 
 
296 aa  51.2  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  34.88 
 
 
341 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>