More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0469 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  96.02 
 
 		 377 aa  703    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  94.69 
 
 		 377 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  100 
 
 		 397 aa  786    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  94.96 
 
 		 377 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  98.24 
 
 		 397 aa  773    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  95.23 
 
 		 377 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  98.24 
 
 		 397 aa  773    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  80.99 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  80.73 
 
 		 425 aa  620  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  81.75 
 
 		 378 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  81.48 
 
 		 378 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  81.48 
 
 		 378 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  81.48 
 
 		 378 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  81.22 
 
 		 378 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  82.23 
 
 		 378 aa  609  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  76.92 
 
 		 376 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  75.07 
 
 		 380 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  75.07 
 
 		 380 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  72.85 
 
 		 381 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  74.54 
 
 		 389 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  71.62 
 
 		 374 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  71.88 
 
 		 374 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  71.65 
 
 		 379 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  69.44 
 
 		 392 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  65.35 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  64.86 
 
 		 368 aa  488  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  63.89 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  64.77 
 
 		 409 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  67.96 
 
 		 388 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  58.29 
 
 		 389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  63.52 
 
 		 384 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  63.28 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  65.89 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  65.36 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  56.39 
 
 		 403 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  60.73 
 
 		 358 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  50.77 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  50.38 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  49.88 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  50.68 
 
 		 378 aa  332  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  53.91 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  53.24 
 
 		 382 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  52.88 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  47.1 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  60.47 
 
 		 89 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  35.96 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.59 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  38.33 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  34.27 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  34.1 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  39.49 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.06 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  28.18 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.76 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  34.53 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 286 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.29 
 
 		 287 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  23.12 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.85 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.16 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  34.65 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1942  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.81 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  29.59 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  26.89 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  33.5 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  31.64 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.87 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  24.38 
 
 		 202 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.66 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.62 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  35.11 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  34.97 
 
 		 490 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  31.65 
 
 		 284 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.93 
 
 		 313 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  34.56 
 
 		 484 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  31.93 
 
 		 284 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  37.78 
 
 		 286 aa  53.1  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.26 
 
 		 295 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  32.79 
 
 		 185 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  32.93 
 
 		 188 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.33 
 
 		 289 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  36.61 
 
 		 231 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  37.11 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4759  modification methylase, HemK family  34.66 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  36.61 
 
 		 231 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  24 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  28.42 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  30.92 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  36.28 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  37.18 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.75 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  33.1 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.92 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  35.19 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.77 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2070  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.83 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.295108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>