45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1322 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  68.54 
 
 		 389 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  63.1 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  62.79 
 
 		 425 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  62.79 
 
 		 378 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  61.63 
 
 		 378 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  63.53 
 
 		 388 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  61.63 
 
 		 378 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  61.63 
 
 		 403 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  61.63 
 
 		 378 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  61.63 
 
 		 378 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  61.63 
 
 		 378 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  60.47 
 
 		 381 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  61.63 
 
 		 396 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  60.47 
 
 		 397 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  59.3 
 
 		 377 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  60.71 
 
 		 425 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  59.3 
 
 		 377 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  60.47 
 
 		 397 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  60.47 
 
 		 397 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  58.14 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  61.18 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  60.47 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  58.14 
 
 		 377 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  61.45 
 
 		 400 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  60.71 
 
 		 417 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  60.71 
 
 		 409 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  60.47 
 
 		 417 aa  105  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  58.14 
 
 		 380 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  60.24 
 
 		 368 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  58.82 
 
 		 390 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  58.14 
 
 		 380 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  58.14 
 
 		 376 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  58.82 
 
 		 390 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  59.04 
 
 		 358 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  56.98 
 
 		 374 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  57.83 
 
 		 404 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  58.14 
 
 		 389 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  57.83 
 
 		 374 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  57.83 
 
 		 404 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  43.9 
 
 		 382 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  44.05 
 
 		 378 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  42.68 
 
 		 382 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  38.55 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  40.26 
 
 		 386 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>