More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0401 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  95.23 
 
 		 397 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  94.69 
 
 		 377 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  98.67 
 
 		 377 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  95.49 
 
 		 397 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  100 
 
 		 377 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  93.9 
 
 		 377 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  95.49 
 
 		 397 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  80.69 
 
 		 378 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  80.69 
 
 		 378 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  80.95 
 
 		 378 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  80.69 
 
 		 378 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  80.42 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  80.42 
 
 		 378 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  80.16 
 
 		 425 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  81.17 
 
 		 378 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  75.39 
 
 		 380 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  75.39 
 
 		 380 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  75.6 
 
 		 376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  75.07 
 
 		 389 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  71.54 
 
 		 381 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  73.21 
 
 		 374 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  72.94 
 
 		 374 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  71.73 
 
 		 379 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  68.9 
 
 		 392 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  63.51 
 
 		 368 aa  481  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  63.61 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  64.95 
 
 		 409 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  67.7 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  63.13 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  58.81 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  64.1 
 
 		 384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  63.52 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  65.62 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  65.36 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  60.73 
 
 		 358 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  56.39 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  50.51 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  50.88 
 
 		 404 aa  347  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  50.37 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  50.95 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  52.56 
 
 		 382 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  47.36 
 
 		 414 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  52.7 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  52.33 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  59.3 
 
 		 89 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  36.52 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.99 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  34.27 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  24 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.58 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.9 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.33 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  39.17 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.95 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  23.5 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.93 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  30 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  26.89 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  34.1 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  37.23 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  32.04 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  39.42 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  31.21 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  31.58 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  36.81 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  37.42 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  29.09 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  36.81 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 		 313 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  31.21 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  34.65 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  31.21 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  36.28 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  40.2 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.3 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  24.88 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  30.07 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  32.79 
 
 		 185 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 		 313 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.16 
 
 		 288 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  34.56 
 
 		 484 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 295 aa  53.9  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  31.07 
 
 		 496 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.18 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  40.43 
 
 		 248 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  34.86 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  40 
 
 		 249 aa  53.1  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  40.38 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  43.24 
 
 		 275 aa  53.1  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  27.71 
 
 		 238 aa  53.1  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.51 
 
 		 314 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2070  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.68 
 
 		 309 aa  53.1  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.295108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 		 315 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.43 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  36.61 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  36.61 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  28.21 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1850  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.65 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966602  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  39.81 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>