253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3426 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  100 
 
 		 417 aa  839    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  69.93 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  67.07 
 
 		 380 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  67.24 
 
 		 376 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  66.34 
 
 		 409 aa  510  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  67.07 
 
 		 380 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  64.78 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  65.02 
 
 		 378 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  64.78 
 
 		 378 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  64.78 
 
 		 425 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  64.78 
 
 		 378 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  64.29 
 
 		 389 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  64.78 
 
 		 378 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  64.78 
 
 		 378 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  64.78 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  64.04 
 
 		 378 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  63.86 
 
 		 381 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  62.84 
 
 		 374 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  64.29 
 
 		 377 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  62.59 
 
 		 374 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  63.31 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  62.81 
 
 		 377 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  63.79 
 
 		 377 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  64.04 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  62.56 
 
 		 377 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  64.04 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  63.21 
 
 		 379 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  65.41 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  60.35 
 
 		 368 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  57.82 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  59.61 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  62.78 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  58.06 
 
 		 384 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  62.78 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  56.05 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  54.24 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  49.51 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  49.88 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  50.36 
 
 		 404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  48.75 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  48.97 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  48.45 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  47.78 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  43.41 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  60.47 
 
 		 89 aa  106  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  34.48 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  28.1 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  28.67 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  44.74 
 
 		 287 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  28.15 
 
 		 238 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.1 
 
 		 313 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  34.33 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  32.84 
 
 		 307 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  40.38 
 
 		 484 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  29.06 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  37.59 
 
 		 288 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  44 
 
 		 496 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  33.78 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.73 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  36.49 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  37.33 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.86 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  29.82 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  28.57 
 
 		 208 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  35.48 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.12 
 
 		 287 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  35.44 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  41.56 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.29 
 
 		 211 aa  50.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.2 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.62 
 
 		 288 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.86 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  35.2 
 
 		 276 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  39.73 
 
 		 270 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32 
 
 		 277 aa  50.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  35.44 
 
 		 280 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  35.2 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  40.66 
 
 		 185 aa  50.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  34.64 
 
 		 205 aa  50.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.09 
 
 		 286 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  37.84 
 
 		 285 aa  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  33.58 
 
 		 204 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  35.14 
 
 		 286 aa  49.7  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  32.73 
 
 		 288 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  42.86 
 
 		 286 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  42.86 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.16 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  33.88 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  34.95 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  37.08 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 280 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  36.99 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.65 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  39.36 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  34.62 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.67 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.65 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>