More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1561 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  100 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  64.9 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  65.33 
 
 
210 aa  251  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  56.35 
 
 
207 aa  223  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  54.82 
 
 
204 aa  221  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  63.92 
 
 
203 aa  218  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  56.92 
 
 
228 aa  215  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  61.42 
 
 
202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  59.9 
 
 
201 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  60.2 
 
 
211 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  54.03 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  56.85 
 
 
201 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  49.29 
 
 
218 aa  202  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  53.12 
 
 
209 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  54.46 
 
 
204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  53.65 
 
 
203 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  43 
 
 
232 aa  186  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  52.55 
 
 
200 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  50.78 
 
 
205 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  50.5 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  49.11 
 
 
227 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  48.6 
 
 
223 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  40.96 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  40.96 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  40.96 
 
 
199 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  40.96 
 
 
199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  40.96 
 
 
199 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  40.96 
 
 
199 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  40.96 
 
 
199 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  38.55 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  35.96 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  37.95 
 
 
199 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  36.75 
 
 
199 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  36.5 
 
 
199 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  34.52 
 
 
202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  33.33 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  31.47 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  31.47 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.64 
 
 
204 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  28.14 
 
 
202 aa  105  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.83 
 
 
211 aa  104  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  31.1 
 
 
186 aa  101  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.34 
 
 
227 aa  101  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  30.26 
 
 
196 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  28.06 
 
 
201 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  36.93 
 
 
199 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  28.57 
 
 
200 aa  98.6  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  29.15 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.61 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  30.89 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  27.45 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  28.06 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  28.06 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  28.5 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  27.78 
 
 
198 aa  89  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  37.59 
 
 
205 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  36.18 
 
 
195 aa  84.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  35.44 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  27.36 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  27.67 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  26.2 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  32.88 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  31.9 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  29.13 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  35.57 
 
 
382 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  34.59 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  28.81 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  31.45 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.22 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  33.12 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  29.27 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  28.57 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  29.14 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.67 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  48.42 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  32.33 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.03 
 
 
342 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.35 
 
 
342 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.35 
 
 
342 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.35 
 
 
342 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002705  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  26.23 
 
 
384 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.588026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.35 
 
 
342 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.35 
 
 
342 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2134  methyltransferase small  33.33 
 
 
418 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.35 
 
 
342 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.76 
 
 
343 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  37.72 
 
 
347 aa  61.6  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.76 
 
 
343 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.76 
 
 
343 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  31.76 
 
 
343 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.76 
 
 
343 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.76 
 
 
343 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.28 
 
 
332 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1886  hypothetical protein  28.17 
 
 
416 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.112919  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.28 
 
 
332 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.28 
 
 
332 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.51 
 
 
283 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.15 
 
 
331 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3445  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.45 
 
 
342 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>