253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17520 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  48.44 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  48.44 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  58.6 
 
 		 202 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  49.11 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  47.35 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  45.7 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  50.23 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  48.87 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  48.31 
 
 		 201 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  46.89 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  41.49 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  44.25 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  40.54 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  44.25 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  45.93 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  45.54 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  39.46 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  44.44 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  43.55 
 
 		 203 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  39 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  40.79 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  38.38 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  38.38 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  38.46 
 
 		 199 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  37.84 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  37.16 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  37.84 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  30.7 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  37.16 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  37.16 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  37.36 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  37.36 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  30.97 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  30.18 
 
 		 196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  32.74 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  32.89 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  29.44 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  29.44 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  31.72 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  28.65 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  26.75 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  30.21 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  28.89 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  30.73 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  30.39 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  35.42 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  28.3 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  30.77 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  29.38 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  30.05 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.08 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  28.92 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  27.68 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  30.05 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  30.24 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  28.29 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  28.99 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  26.43 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  27.98 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  31.11 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  33.33 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  32.46 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  29.74 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  31.79 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  32.6 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  29.82 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  25.25 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  29.38 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  36.19 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  42.7 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  27.04 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.29 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0079  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.11 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  31.88 
 
 		 353 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  26.99 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.35 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.92 
 
 		 345 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  27.27 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  41.3 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  34.58 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.86 
 
 		 320 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.02 
 
 		 331 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  34.69 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.05 
 
 		 353 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  34.45 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  27.43 
 
 		 281 aa  52.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0687  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.04 
 
 		 353 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3335  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.04 
 
 		 353 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.533815 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.08 
 
 		 280 aa  52.4  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2977  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.72 
 
 		 345 aa  51.6  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  27.27 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  37.23 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  39.81 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.35 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40.66 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2383  Methylase of polypeptide chain release factors-like protein  33.33 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  42.5 
 
 		 288 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  42.31 
 
 		 316 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  28.35 
 
 		 275 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>