More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0213 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  59.79 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  53.8 
 
 		 205 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  51.35 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  52.88 
 
 		 196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  49.73 
 
 		 202 aa  198  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  49.73 
 
 		 202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  33.88 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  35.8 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  36.31 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  33.68 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  35.71 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  34.46 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  33.15 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  36.11 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  37.59 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.46 
 
 		 227 aa  96.3  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  34.05 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  36 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  35.57 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  33.89 
 
 		 225 aa  94.7  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  36.88 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  34.09 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  37.5 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  37.74 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  38.03 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  35.46 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.15 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  35.46 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  35.46 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  35.46 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  35.46 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  35.46 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  35.53 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  35.46 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  40.14 
 
 		 204 aa  87.8  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  34.48 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  31.35 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  31.35 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  34.66 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  34.62 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  31.84 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.32 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  35.62 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  35.88 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  32.88 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  31.71 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  29.51 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  29.44 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  37.23 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  30.77 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  35.44 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  32.72 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  35.04 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  34.56 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  28.11 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  32.95 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  33.33 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.81 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  33.79 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  31.82 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  32.95 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  31.17 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  33.53 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.47 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  35.1 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.57 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.25 
 
 		 365 aa  67.8  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.47 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  31.17 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3551  methyltransferase family protein  28.04 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.715445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  31.32 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  28.57 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  29.69 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3266  methyltransferase family protein  27.51 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02953  predicted methyltransferase small domain protein  27.51 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.932985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0617  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.51 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0616  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.51 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02903  hypothetical protein  27.51 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3376  methyltransferase family protein  27.51 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4398  methyltransferase family protein  27.51 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2548  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.63 
 
 		 383 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3411  methyltransferase family protein  26.53 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.77 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3407  methyltransferase family protein  26.53 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.77 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3481  methyltransferase family protein  27.12 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.12 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3577  methyltransferase family protein  26.53 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.227162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3515  methyltransferase family protein  27.12 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000598825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0753  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0536  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.52 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.12 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3520  methyltransferase family protein  26.98 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.06 
 
 		 320 aa  62  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.46 
 
 		 378 aa  61.6  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4312  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.23 
 
 		 379 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.75 
 
 		 342 aa  61.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0079  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.06 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4140  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.61 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.449195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>