More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  100 
 
 		 204 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  53.17 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  54.46 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  50.98 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  52.02 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  52.48 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  49.49 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  46.08 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  44.34 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  52.76 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  50.75 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  49.75 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  49.25 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  49.01 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  43.9 
 
 		 232 aa  161  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  45.69 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  46.7 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  49.25 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  44.25 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  45.45 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  41.96 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  41.95 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  32.34 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  34.16 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  29.44 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  29.44 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  31.98 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  34.5 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  34.5 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  34.5 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  34.5 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  34.5 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.3 
 
 		 217 aa  97.8  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  29.41 
 
 		 196 aa  97.8  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  34.5 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  34.5 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  33.92 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  33.92 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  25.76 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  32.95 
 
 		 199 aa  91.7  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  33 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  29.67 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  33.33 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.84 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  30 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  30.23 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  27.5 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  35.29 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  30.17 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  27.5 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.24 
 
 		 227 aa  84.7  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  27 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  25 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  28.79 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  29.5 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  35.39 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  23.67 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  29 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  23.62 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  28.08 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  24.75 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  32.64 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  31.47 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  32.98 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  31.16 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.92 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.76 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  34.71 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.02 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  28.67 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  37.5 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  29.05 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  48.68 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  37.8 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  34.13 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  30.73 
 
 		 382 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0790  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.89 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.960699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  31.28 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.62 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4279  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.41 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  27.74 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.72 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  29.22 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  30.27 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  35.34 
 
 		 306 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.66 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4890  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.38 
 
 		 374 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2886  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.51 
 
 		 401 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  34.07 
 
 		 300 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4712  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.78 
 
 		 332 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0865771  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  33.12 
 
 		 284 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.07 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07730  rRNA (guanine-N(2))-methyltransferase  28.32 
 
 		 374 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  24.06 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3032  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.92 
 
 		 349 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4642  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.32 
 
 		 374 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.62 
 
 		 297 aa  52.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.86 
 
 		 333 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  25.17 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>