More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0163 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  64.79 
 
 		 232 aa  281  6.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  51.38 
 
 		 210 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  51.17 
 
 		 207 aa  211  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  48.23 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  49.29 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  48.58 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  51.16 
 
 		 202 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  50.23 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  51.42 
 
 		 203 aa  191  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  44.55 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  48.83 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  44 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  44.55 
 
 		 203 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  46.05 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  46.08 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  41.98 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  43.46 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  45.33 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  41.4 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  41.4 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  41.49 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  38.14 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  38.14 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  38.14 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  38.14 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  38.14 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  38.14 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  38.14 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  36.28 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  36.57 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  37.67 
 
 		 199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  37.21 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  38.03 
 
 		 199 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  36.74 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  33.02 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  31.16 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  31.16 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.42 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  29.3 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  31.6 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  31.6 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  32.86 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  31.13 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  35.35 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  33.67 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.04 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  31.46 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  29.52 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  27.75 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  31.28 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  29.77 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  36.13 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  31.12 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.13 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  34.22 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  31.63 
 
 		 198 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  27.49 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  28.57 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  29.53 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  34.59 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  36.88 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  35.44 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  34.13 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  29.59 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  32.43 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  32.97 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  27.17 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  29.86 
 
 		 390 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  29.61 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3978  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.13 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  42.53 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4140  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.11 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.449195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3515  methyltransferase family protein  29.95 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000598825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.85 
 
 		 332 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.81 
 
 		 347 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  33.76 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3411  methyltransferase family protein  29.41 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3577  methyltransferase family protein  29.41 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.227162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.6 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.79 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.81 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.27 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.81 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0806  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  45.95 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0831  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  45.95 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000982153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0838  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  45.95 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3530  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  45.95 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02953  predicted methyltransferase small domain protein  31.28 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.932985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0617  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.28 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3551  methyltransferase family protein  31.28 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.715445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  26.06 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0616  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.28 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02903  hypothetical protein  31.28 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1886  hypothetical protein  39.47 
 
 		 416 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.112919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3266  methyltransferase family protein  31.28 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2276  methyltransferase small  26.88 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3407  methyltransferase family protein  28.88 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002588  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  31.21 
 
 		 341 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4398  methyltransferase family protein  31.28 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>