More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3892 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  100 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  92.54 
 
 		 201 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  62.24 
 
 		 200 aa  235  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  59.9 
 
 		 205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  57.56 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  52.45 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  54.36 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  55.12 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  50.76 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  49.51 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  51.28 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  50 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  49.49 
 
 		 228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  54.77 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  49.76 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  46.05 
 
 		 218 aa  174  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  43.06 
 
 		 232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  49.75 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  47.14 
 
 		 227 aa  157  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  42.93 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  44.29 
 
 		 223 aa  150  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  44.83 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  35 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  35 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  35 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  34.5 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  34.5 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  35 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  34.5 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  33.67 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  33.17 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  33.67 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  31.66 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  31.16 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  30.69 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  30.69 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  30.5 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  30.3 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  31.53 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  30.96 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  28.22 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  28.06 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  30.46 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  35 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  32.65 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  31.46 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  30.21 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  32 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  30.15 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  29.21 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  32.67 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  26.37 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  28.87 
 
 		 225 aa  92.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  32.2 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  29.8 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  28.14 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  31.44 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  29.08 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.76 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  29.9 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  33.73 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  31.64 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  32.5 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  34.57 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  31.68 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.65 
 
 		 342 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  30.86 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  32.4 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.1 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  34.94 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  29.69 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3978  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.02 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.5 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  29.14 
 
 		 353 aa  61.6  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.88 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.68 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.68 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.14 
 
 		 353 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2276  methyltransferase small  32.21 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2134  methyltransferase small  33.14 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2977  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.94 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2551  methyltransferase small  33.56 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.473932  normal  0.100873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4712  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.56 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0865771  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  33.71 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0597  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.94 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  27.21 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3164  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.01 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.908437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  31.54 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.94 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  26.71 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  27.59 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61220  hypothetical protein  35.03 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.527408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0687  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  28.57 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3335  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  28.57 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.533815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.28 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0838  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.93 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0806  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.93 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0831  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.93 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000982153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3530  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.93 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  44.33 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>