More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2437 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  100 
 
 
203 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  63.92 
 
 
205 aa  235  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  61.27 
 
 
210 aa  235  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  56.06 
 
 
207 aa  211  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  49.51 
 
 
232 aa  206  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  51.42 
 
 
218 aa  205  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  57.97 
 
 
211 aa  205  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  59.61 
 
 
202 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  56.5 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  52 
 
 
204 aa  197  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  56.5 
 
 
201 aa  197  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  53.06 
 
 
228 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  52.61 
 
 
217 aa  194  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  49 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  50.5 
 
 
200 aa  178  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  51.3 
 
 
205 aa  178  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  50 
 
 
227 aa  177  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  47.49 
 
 
223 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  49.24 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  49.5 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  45.75 
 
 
225 aa  171  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  49.25 
 
 
204 aa  170  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  37.88 
 
 
199 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  37.37 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  36.87 
 
 
199 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  35.35 
 
 
199 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  35.5 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  35.35 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  35.35 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  35.5 
 
 
199 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  35.5 
 
 
199 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  35.5 
 
 
199 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  34.85 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  36.49 
 
 
202 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  33.84 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  31.82 
 
 
196 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  31.53 
 
 
202 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  36.36 
 
 
211 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  36 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  31.16 
 
 
200 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  31.63 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  31.12 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  32.34 
 
 
202 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  32.34 
 
 
202 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  37.65 
 
 
199 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  32.14 
 
 
196 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  27.05 
 
 
201 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  30.41 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  29.05 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  27.86 
 
 
198 aa  98.2  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.17 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  32.31 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  28.33 
 
 
186 aa  92.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  30.35 
 
 
198 aa  89  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  26.02 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  27.27 
 
 
206 aa  85.1  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  26.47 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  26.24 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  32.12 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  25.25 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  27.14 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  28.57 
 
 
390 aa  75.5  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  35.14 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  34.57 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  30.46 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.36 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  31.95 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  30.95 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  32.65 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.33 
 
 
320 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.52 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.34 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  39.34 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.34 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  39.34 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.34 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.52 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.52 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  39.34 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.52 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.52 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002705  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  26.06 
 
 
384 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.588026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.39 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3978  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.08 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  29.61 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.52 
 
 
343 aa  64.7  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.52 
 
 
343 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.52 
 
 
343 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.15 
 
 
332 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  31.76 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.15 
 
 
332 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002588  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  31.58 
 
 
341 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.26 
 
 
331 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  31.29 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0685  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.25 
 
 
333 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3032  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.67 
 
 
349 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  31.98 
 
 
333 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  31.28 
 
 
333 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  26.6 
 
 
357 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2276  methyltransferase small  31.58 
 
 
312 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>