More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2367 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  68.09 
 
 		 195 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  53.8 
 
 		 192 aa  221  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  51.83 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  51.61 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  51.08 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  48.63 
 
 		 196 aa  187  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  37.99 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  36.11 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  34.32 
 
 		 200 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  37.99 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  33.94 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  33.33 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  39.61 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  31.07 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  32.4 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  34.62 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  31.25 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  35.09 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  35.92 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  38.85 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  31.25 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  31.25 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  38.57 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  35.19 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  35.19 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  35.19 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  32.76 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  35.19 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.07 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  35.19 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  39.1 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  35.19 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  35.19 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  36.43 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  40 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  37.04 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  36.13 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  30.43 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  38.64 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  31.76 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  32 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  37.59 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  31.18 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  38.22 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.32 
 
 		 365 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  32.1 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  27.84 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.33 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  34.97 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  32.57 
 
 		 186 aa  84.7  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  30.41 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  33.95 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  31.48 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  30.25 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.86 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  33.33 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  30.29 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  28.49 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  31.47 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  28.49 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  31.11 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  29.7 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  29.24 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  30.26 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  28.89 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0536  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.96 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0753  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.47 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  34.87 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  26.26 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2296  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.3 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3551  methyltransferase family protein  28.73 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.715445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  30.86 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.11 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02953  predicted methyltransferase small domain protein  28.49 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.932985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0617  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.49 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4398  methyltransferase family protein  28.49 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.64 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3266  methyltransferase family protein  28.73 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03277  16S RNA G1207 methylase RsmC  25.13 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3376  methyltransferase family protein  28.49 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0616  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.49 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  30.86 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02903  hypothetical protein  28.49 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0079  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.49 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.36 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.82 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.82 
 
 		 342 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.82 
 
 		 342 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.36 
 
 		 332 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.24 
 
 		 343 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.24 
 
 		 343 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  29.24 
 
 		 343 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.82 
 
 		 342 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.24 
 
 		 343 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.24 
 
 		 343 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.82 
 
 		 342 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.82 
 
 		 342 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3407  methyltransferase family protein  27.43 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>