More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1254 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  100 
 
 
210 aa  414  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  62.84 
 
 
217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  65.33 
 
 
205 aa  251  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  55.17 
 
 
207 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  61.27 
 
 
203 aa  218  7.999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  55.17 
 
 
204 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  51.38 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  59.02 
 
 
202 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  57.56 
 
 
201 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  48.1 
 
 
232 aa  203  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  53.37 
 
 
209 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  55.56 
 
 
211 aa  201  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  54.27 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  55.12 
 
 
201 aa  197  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  47.87 
 
 
225 aa  192  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  49.76 
 
 
228 aa  191  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  50.98 
 
 
204 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  51.24 
 
 
200 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  50.45 
 
 
223 aa  184  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  47.83 
 
 
205 aa  168  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  47.74 
 
 
205 aa  167  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  52.08 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  39.2 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  39.2 
 
 
199 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  38.07 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  38.07 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  38.07 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  33.5 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  37.5 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  37.5 
 
 
199 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  34.47 
 
 
202 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  33.17 
 
 
200 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  37.5 
 
 
199 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  37.5 
 
 
199 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  36.36 
 
 
199 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  35.32 
 
 
199 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  33.5 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  33.5 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  31.34 
 
 
200 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  31.34 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.31 
 
 
211 aa  108  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  30.69 
 
 
202 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  29.9 
 
 
198 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.52 
 
 
227 aa  104  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.15 
 
 
204 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  29.85 
 
 
200 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  31.25 
 
 
186 aa  101  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  33.73 
 
 
196 aa  101  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  32.77 
 
 
196 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  27.4 
 
 
201 aa  99  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  28.22 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  36 
 
 
199 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  39.1 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.65 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  26.96 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  35.53 
 
 
192 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  35.88 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  27.8 
 
 
198 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  27.46 
 
 
206 aa  85.1  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  29 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  36.84 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  28.64 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  31 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  28 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2380  methyltransferase small  36.36 
 
 
382 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  51.06 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  30.22 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  31.28 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.17 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  31.18 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3032  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.68 
 
 
349 aa  65.1  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  30.22 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002588  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  31.16 
 
 
341 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  36.49 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  31.62 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  39.29 
 
 
288 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002705  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  25.4 
 
 
384 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.588026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  30.41 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  32.61 
 
 
279 aa  62.4  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  40.54 
 
 
301 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 
280 aa  61.6  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  40.87 
 
 
276 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  30.37 
 
 
341 aa  61.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.81 
 
 
320 aa  61.2  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  41.12 
 
 
279 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  28.05 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0079  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.76 
 
 
343 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32 
 
 
331 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32 
 
 
332 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0597  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.67 
 
 
341 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  36.54 
 
 
284 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32 
 
 
332 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  28 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  30.77 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0838  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.82 
 
 
347 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  35.58 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  40 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  47.25 
 
 
285 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3978  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.46 
 
 
343 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3530  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.21 
 
 
347 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>