More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1368 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  100 
 
 
186 aa  365  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  51.91 
 
 
186 aa  193  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  35.96 
 
 
202 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  38.07 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  38.07 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  38.07 
 
 
199 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  38.07 
 
 
199 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  38.07 
 
 
199 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  38.07 
 
 
199 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  38.07 
 
 
199 aa  110  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  38.07 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  38.82 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  38.07 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.16 
 
 
205 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  32.4 
 
 
228 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  33.88 
 
 
192 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  35.2 
 
 
200 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.5 
 
 
217 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  35.2 
 
 
199 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  38.32 
 
 
196 aa  101  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  31.25 
 
 
210 aa  101  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  31.1 
 
 
205 aa  101  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  32.29 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  32.29 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  30.73 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  32.26 
 
 
195 aa  98.6  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.88 
 
 
217 aa  98.6  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  30.25 
 
 
225 aa  98.6  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.51 
 
 
227 aa  97.1  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.81 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  29.15 
 
 
223 aa  96.3  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  32 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  32 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  94.7  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  34.86 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  36.36 
 
 
207 aa  94.7  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  28.09 
 
 
209 aa  94.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  34.62 
 
 
202 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  35.06 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  32.76 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  30.86 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  33.53 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  31.72 
 
 
200 aa  92  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  30.11 
 
 
198 aa  91.7  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  30.65 
 
 
200 aa  91.3  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0079  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.03 
 
 
343 aa  91.3  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  33.72 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.67 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  33.91 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  35.83 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  33.56 
 
 
200 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  39.39 
 
 
201 aa  89  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  29.47 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03421  16S rRNA m2G 1207 methyltransferase  40.35 
 
 
341 aa  88.2  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002588  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  40.35 
 
 
341 aa  88.2  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  35.39 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  28.74 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  33.33 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  28.33 
 
 
203 aa  85.1  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  29.53 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  37.04 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  34.27 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  31.82 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0569  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.67 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  28.57 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00279  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  33.56 
 
 
360 aa  81.3  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  25.57 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  32.72 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3032  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  38.46 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  34.09 
 
 
332 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.46 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0151  hypothetical protein  31.72 
 
 
340 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.09 
 
 
332 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4494  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  30.92 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.8 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2508  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.64 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.21 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.21 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  32.77 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  28.09 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  35.92 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.21 
 
 
333 aa  75.5  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.97 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.74 
 
 
343 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.74 
 
 
343 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.74 
 
 
343 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  32.74 
 
 
343 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.74 
 
 
343 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.63 
 
 
342 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.86 
 
 
343 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.74 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  37.38 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.74 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2548  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.91 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.74 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.74 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.39 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.4 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.56 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3636  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.74 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>