More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0056 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  100 
 
 		 202 aa  428  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  82.18 
 
 		 202 aa  358  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  81.19 
 
 		 202 aa  355  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  54.84 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  51.83 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  51.35 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  42.41 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  35.4 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  36.02 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  32.02 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  31.46 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  33.33 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  31.22 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  30.51 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  32.61 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  32.96 
 
 		 196 aa  92.4  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  32.58 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  31.64 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  29.69 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  30.19 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  30.57 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  31.64 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  31.64 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  30 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  28.96 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  28.72 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  25.57 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  31.52 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  28.8 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  28.47 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  28.72 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.25 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  28.82 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  28.57 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  31.21 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  31.21 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  31.21 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.77 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2296  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.46 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2886  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.46 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  31.21 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  31.21 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  31.21 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  31.21 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  29.63 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.56 
 
 		 332 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.56 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  29.31 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.35 
 
 		 331 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  30.34 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  37.72 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  29.66 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  30.29 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3506  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.24 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4312  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.49 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  28.49 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  29.41 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  30.95 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3376  methyltransferase family protein  27.17 
 
 		 378 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02953  predicted methyltransferase small domain protein  27.17 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.932985  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0617  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.17 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2937  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.27 
 
 		 383 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4398  methyltransferase family protein  27.17 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0616  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.17 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  29.08 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02903  hypothetical protein  27.17 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4712  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.32 
 
 		 332 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0865771  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  28.81 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3481  methyltransferase family protein  26.44 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.05 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3515  methyltransferase family protein  26.44 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000598825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3540  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.17 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3266  methyltransferase family protein  26.59 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  32.14 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0968  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.38 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3411  methyltransferase family protein  26.44 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3407  methyltransferase family protein  26.44 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0932  methyltransferase small  29.38 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  27.59 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  28.19 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0930  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.14 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0536  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.24 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3577  methyltransferase family protein  26.44 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.227162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3551  methyltransferase family protein  26.59 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.715445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0753  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.47 
 
 		 379 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.07 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.93 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3520  methyltransferase family protein  26.59 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2548  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.68 
 
 		 383 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  27.51 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  28.37 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  27.17 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  30.46 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  28.57 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.93 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1097  hypothetical protein  29.59 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3380  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.01 
 
 		 380 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4279  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.59 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  30 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>