More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2545 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  100 
 
 		 390 aa  766    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  95.12 
 
 		 390 aa  683    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  70.66 
 
 		 388 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  63.92 
 
 		 380 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  63.92 
 
 		 380 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  64.14 
 
 		 381 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  62 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  64.3 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  62.5 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  64.64 
 
 		 376 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  62.78 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  64.66 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  64.66 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  64.66 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  64.66 
 
 		 378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  64.66 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  65.01 
 
 		 392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  64.66 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  64.66 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  62.2 
 
 		 374 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  65.36 
 
 		 377 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  63.32 
 
 		 403 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  65.36 
 
 		 377 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  64.84 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  64.84 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  64.92 
 
 		 378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  62.09 
 
 		 409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  61.94 
 
 		 374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  64.58 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  64.58 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  64.58 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  61.32 
 
 		 379 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  57.74 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  59.34 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  54.01 
 
 		 389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  57.03 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  51.01 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  54.04 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  54.04 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  49.08 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  49.87 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  49.6 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  45.86 
 
 		 414 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  49.2 
 
 		 386 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  58.82 
 
 		 89 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.07 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  32.33 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4470  methyltransferase small  35.15 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.820054 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  26.9 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  31.25 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  35.98 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  40.17 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  24.72 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  29.03 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  25.82 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  31.9 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.6 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  46.43 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  46.43 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  33.62 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  31 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  28.89 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  23.44 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  25.14 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  35.66 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  37.36 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  45 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  41.03 
 
 		 288 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  38.46 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.28 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  37.97 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  34.71 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  47.44 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.7 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.73 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  28.49 
 
 		 247 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  34.69 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  37.93 
 
 		 283 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  25.93 
 
 		 262 aa  54.7  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.38 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  30.51 
 
 		 202 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.19 
 
 		 289 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 315 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  34.21 
 
 		 515 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  25.56 
 
 		 288 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  30.39 
 
 		 231 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  32.41 
 
 		 285 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  47.37 
 
 		 484 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 		 313 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  33.96 
 
 		 578 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.71 
 
 		 286 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  35.59 
 
 		 276 aa  53.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0432  HemK family modification methylase  30.3 
 
 		 282 aa  53.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  30.34 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  31.25 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.43 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  34.65 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  34.85 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.63 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>