279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1753 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  49.3 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4470  methyltransferase small  46 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.820054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  34.73 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  34.52 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  33.53 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  33.53 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  33.87 
 
 		 414 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  33.77 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  30.34 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  31.93 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  31.93 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  28.57 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  28.65 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  29.7 
 
 		 389 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  28.89 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  29.05 
 
 		 400 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  29.48 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  29.48 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  29.32 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  37.89 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  29.81 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  35.16 
 
 		 578 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1261  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.44 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0715503  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  29.41 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1896  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.25 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.43 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1325  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.18 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  29.53 
 
 		 177 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  28.57 
 
 		 392 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  31.3 
 
 		 289 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  27.55 
 
 		 284 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7889  methyltransferase small  30.91 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  27.73 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.72 
 
 		 287 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  27.01 
 
 		 378 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  24.18 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  33.07 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  38.96 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1352  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.17 
 
 		 295 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.57 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  29.69 
 
 		 409 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  24.27 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  32.97 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  32.97 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  32.14 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  26.44 
 
 		 425 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5342  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.69 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1244  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.87 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  26.06 
 
 		 368 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1388  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.89 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  28.48 
 
 		 377 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  31.33 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  40 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.1 
 
 		 299 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  37.66 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  28.16 
 
 		 358 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  34.88 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 295 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 		 316 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3777  hypothetical protein  27.21 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  27.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  25.86 
 
 		 396 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  25.86 
 
 		 378 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  30.35 
 
 		 307 aa  48.9  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2052  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.87 
 
 		 302 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  25.86 
 
 		 378 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6044  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.87 
 
 		 302 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2033  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.87 
 
 		 302 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  25.86 
 
 		 378 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  25.86 
 
 		 378 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.52 
 
 		 317 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  27.81 
 
 		 377 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  27.15 
 
 		 377 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.42 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11150  16S RNA G1207 methylase RsmC  36.67 
 
 		 401 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  28.64 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.66 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  32.74 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  29.46 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  25 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  23.08 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1344  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.89 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1569  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.89 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.340756  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  31.29 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  28.23 
 
 		 389 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  29.01 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.72 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  27.01 
 
 		 378 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.36 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  22.66 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2072  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.89 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3240  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.89 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56326  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  27.81 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1540  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.68 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>