268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1253 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  100 
 
 
388 aa  755    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  68.31 
 
 
381 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  72.45 
 
 
390 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  71.17 
 
 
390 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  68.72 
 
 
376 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  66.42 
 
 
417 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  68.73 
 
 
377 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  65.13 
 
 
380 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  65.13 
 
 
380 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  64.9 
 
 
417 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  64.58 
 
 
374 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  67.96 
 
 
397 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  67.96 
 
 
377 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  66.67 
 
 
379 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  67.44 
 
 
397 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  66.32 
 
 
392 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  68.22 
 
 
377 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  67.44 
 
 
397 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  68.22 
 
 
377 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  65.36 
 
 
389 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  66.75 
 
 
378 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  66.49 
 
 
378 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  66.75 
 
 
378 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  66.75 
 
 
425 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  67.53 
 
 
378 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  66.49 
 
 
378 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  66.49 
 
 
378 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  66.49 
 
 
396 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  61.44 
 
 
368 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  63.8 
 
 
374 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  64.12 
 
 
409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  65.44 
 
 
425 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  56.07 
 
 
389 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  61.68 
 
 
403 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  59.48 
 
 
384 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  56.15 
 
 
358 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  48.5 
 
 
400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  50.38 
 
 
404 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  50.5 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  48.18 
 
 
378 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  48.19 
 
 
382 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  48.96 
 
 
382 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  45.3 
 
 
414 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  47.27 
 
 
386 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  63.53 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  36.29 
 
 
227 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  33.53 
 
 
280 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.34 
 
 
280 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  25.71 
 
 
202 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  31.07 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  29.89 
 
 
286 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  32.33 
 
 
307 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  30.51 
 
 
282 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  30.51 
 
 
282 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  33.11 
 
 
227 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  30.51 
 
 
282 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  29.89 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  29.55 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  34.91 
 
 
307 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  32.57 
 
 
285 aa  57  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  26.36 
 
 
208 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  27.36 
 
 
262 aa  56.2  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  23.12 
 
 
202 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  35.34 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  35.85 
 
 
490 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  38.46 
 
 
333 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  40 
 
 
484 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  34.38 
 
 
185 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  36.79 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  38.99 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  30.51 
 
 
282 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  37.5 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  37.67 
 
 
508 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  40.87 
 
 
486 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  28.98 
 
 
286 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  34.1 
 
 
280 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  30.54 
 
 
280 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.36 
 
 
286 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  37.59 
 
 
288 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.08 
 
 
280 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  37.76 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  24.28 
 
 
202 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.93 
 
 
270 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  36.43 
 
 
480 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  32.3 
 
 
284 aa  53.1  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.84 
 
 
313 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  29.94 
 
 
280 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  24.11 
 
 
202 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  36.59 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  41.24 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.25 
 
 
290 aa  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0685  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  37.76 
 
 
333 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  33.18 
 
 
286 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.5 
 
 
367 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.49 
 
 
313 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  32.16 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  30.14 
 
 
277 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  38.26 
 
 
283 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 
276 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>