272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2124 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  100 
 
 		 392 aa  772    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  67.99 
 
 		 380 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  67.99 
 
 		 380 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  68.45 
 
 		 376 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  68.1 
 
 		 378 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  68.36 
 
 		 378 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  68.1 
 
 		 378 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  68.1 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  68.36 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  69.97 
 
 		 378 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  68.1 
 
 		 378 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  68.1 
 
 		 378 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  65.78 
 
 		 381 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  64.59 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  68.55 
 
 		 379 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  69.97 
 
 		 377 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  68.98 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  69.44 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  68.98 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  69.17 
 
 		 377 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  65.68 
 
 		 374 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  68.9 
 
 		 377 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  68.9 
 
 		 377 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  65.23 
 
 		 389 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  64.86 
 
 		 374 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  64.68 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  61.23 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  65.54 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  59.23 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  60.59 
 
 		 384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  63.57 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  56.66 
 
 		 389 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  65.54 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  64.75 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  61.22 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  58.99 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  49.11 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  52.27 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  51.15 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  50.51 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  48.16 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  49.2 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  44.17 
 
 		 414 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  47.71 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  61.18 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  27.04 
 
 		 202 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.33 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  33.63 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  26.26 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  26.77 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.33 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  29.09 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  35.71 
 
 		 278 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  24.05 
 
 		 208 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  25.38 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  37.19 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.12 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0498  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.24 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  34.62 
 
 		 288 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  34.4 
 
 		 185 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  29.09 
 
 		 226 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  32.67 
 
 		 270 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.43 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  28.07 
 
 		 227 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  29.33 
 
 		 243 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.35 
 
 		 302 aa  53.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.84 
 
 		 313 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.05 
 
 		 299 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  36.64 
 
 		 345 aa  53.1  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  36.62 
 
 		 188 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  32.59 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  35.71 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  30.37 
 
 		 164 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  30.73 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  32.72 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  28.57 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.53 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.7 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  32.5 
 
 		 275 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1460  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.17 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.33 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  31.21 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  39.02 
 
 		 578 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.79 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  31.64 
 
 		 204 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  30.67 
 
 		 231 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  31.65 
 
 		 284 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  27.59 
 
 		 276 aa  50.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  26.58 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.29 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  34.67 
 
 		 378 aa  50.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.59 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  22.53 
 
 		 238 aa  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  36.55 
 
 		 515 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  34.76 
 
 		 278 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  30.8 
 
 		 286 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  36.67 
 
 		 287 aa  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  32.35 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.41 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  30.37 
 
 		 234 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>