89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1562 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  100 
 
 
425 aa  828    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  65.5 
 
 
381 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  63.06 
 
 
379 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  60.05 
 
 
376 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  64.07 
 
 
392 aa  472  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  59.9 
 
 
380 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  59.9 
 
 
380 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  61.6 
 
 
378 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  61.6 
 
 
378 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  58.43 
 
 
374 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  61.6 
 
 
396 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  61.39 
 
 
389 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  61.85 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  61.85 
 
 
378 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  61.6 
 
 
378 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  61.85 
 
 
378 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  62.09 
 
 
378 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  62.69 
 
 
397 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  63.43 
 
 
377 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  62.44 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  62.94 
 
 
377 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  62.94 
 
 
377 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  62.44 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  58.02 
 
 
374 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  61.94 
 
 
377 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  64.22 
 
 
388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  58.98 
 
 
409 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  59.24 
 
 
417 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  54 
 
 
368 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  54.92 
 
 
417 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  56.39 
 
 
403 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  56.19 
 
 
384 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  60.24 
 
 
390 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  50.61 
 
 
389 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  60.05 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  51.87 
 
 
358 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  47.13 
 
 
400 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  47.14 
 
 
404 aa  344  2e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  48.2 
 
 
404 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  46.44 
 
 
378 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  45.88 
 
 
382 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  47.51 
 
 
382 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  42.82 
 
 
414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  46.21 
 
 
386 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  60.71 
 
 
89 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  24.76 
 
 
202 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  30.86 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  21.17 
 
 
202 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  23.85 
 
 
202 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.73 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  25 
 
 
227 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  23.02 
 
 
262 aa  50.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  21.36 
 
 
202 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  27.52 
 
 
226 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  33.77 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  30.65 
 
 
278 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  30.46 
 
 
231 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  30.46 
 
 
231 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  21.94 
 
 
208 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  33.82 
 
 
292 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  30.46 
 
 
231 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1445  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.57 
 
 
369 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.15 
 
 
309 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.29 
 
 
313 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.08 
 
 
276 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  28.45 
 
 
288 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  36.28 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  26.94 
 
 
227 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.59 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  27.54 
 
 
270 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1941  methyltransferase type 11  46.51 
 
 
194 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  24.6 
 
 
244 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  30.94 
 
 
484 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  33.87 
 
 
287 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
280 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.68 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  27.98 
 
 
285 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  31.65 
 
 
289 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  27.96 
 
 
263 aa  43.9  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  36.79 
 
 
289 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  24.75 
 
 
238 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  26.21 
 
 
293 aa  43.5  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  24.42 
 
 
238 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  34.58 
 
 
498 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  30.46 
 
 
204 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  30.08 
 
 
297 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  29.85 
 
 
302 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  31.11 
 
 
307 aa  43.1  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  26.84 
 
 
284 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>