More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1941 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1941  methyltransferase type 11  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0306  methyltransferase type 11  51.2 
 
 		 165 aa  169  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  52.41 
 
 		 165 aa  159  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1298  methyltransferase type 11  45.78 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0784  methyltransferase type 11  48 
 
 		 132 aa  99.4  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.93 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2861  methyltransferase type 12  42.42 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.7 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.63 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.54 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.32 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.32 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  36.73 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 271 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 259 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  37.23 
 
 		 275 aa  52  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.61 
 
 		 293 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 348 aa  52  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  34.02 
 
 		 287 aa  52  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.34 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 262 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.54 
 
 		 263 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.65 
 
 		 251 aa  51.2  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 262 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.84 
 
 		 239 aa  51.2  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.33 
 
 		 251 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0930  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.38 
 
 		 251 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  37.38 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0228  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.38 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.38 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  30.63 
 
 		 325 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  39.36 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 287 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.38 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.05 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2318  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.38 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2970  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.61 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 255 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.86 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  41.49 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.38 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 307 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  27.46 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 332 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2818  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.59 
 
 		 250 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  31.21 
 
 		 309 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.4 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  31.63 
 
 		 261 aa  48.9  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 302 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.65 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.63 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 341 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 341 aa  48.9  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.91 
 
 		 256 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.63 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 291 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.91 
 
 		 256 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>