283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0281 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  44.66 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  39.61 
 
 
275 aa  199  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  35.52 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  35.54 
 
 
270 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
270 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  31.56 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
279 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  31.94 
 
 
268 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.69 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  34.64 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  29.9 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.56 
 
 
352 aa  87  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  30.69 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.49 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  28.86 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  28.25 
 
 
279 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.1 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  26.19 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.09 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  28.16 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  25.12 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  25.21 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  27.01 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  24.75 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  35.88 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  28.81 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  31.4 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  27.32 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  22.18 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  28.17 
 
 
286 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  30.19 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  28.78 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  28.33 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  27.7 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  27.78 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  26.26 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  26.83 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  28.06 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  30.33 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  22.35 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  30.17 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  22.49 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  27.5 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  22.84 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  26.94 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  27.74 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  27.5 
 
 
208 aa  52.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  26.47 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  26.26 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  29.79 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  30.39 
 
 
254 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  24.06 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  20.22 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  23.14 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  21.43 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  32.29 
 
 
199 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  24.68 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  27.95 
 
 
439 aa  50.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  28.04 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 
271 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2709  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.57 
 
 
217 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
259 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  29.03 
 
 
378 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  22.07 
 
 
226 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.46 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  37.14 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.71 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  24.64 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.4 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  32.84 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.8 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.8 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  26.47 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  22.89 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  26.53 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  40 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.2 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>