202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0150 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  46.47 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  46.07 
 
 
270 aa  247  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  36.14 
 
 
302 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  32.84 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.8 
 
 
352 aa  139  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  32.48 
 
 
270 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  29.1 
 
 
275 aa  123  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  28.52 
 
 
274 aa  118  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  31.37 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  31.56 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  29.86 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  28.32 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
279 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
287 aa  105  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  32.16 
 
 
264 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  27.7 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.61 
 
 
279 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  25.71 
 
 
283 aa  92.4  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  24 
 
 
286 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  26.29 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.64 
 
 
278 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  26.22 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  26.19 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  27.76 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  26.24 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  26.71 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  23.72 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  30.47 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  30.2 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  30.2 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  25.18 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  21.38 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  33.18 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  26.79 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  32.3 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  22.89 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  36.49 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  24.89 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  29.06 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  32.53 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  21.29 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  28.63 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  22.55 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  25.2 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  25.43 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  28.83 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  27.92 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  26.32 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  23.31 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  27.48 
 
 
191 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  26.67 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  26.47 
 
 
323 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  34.31 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  20 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0647  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.49 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.14282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0606  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  31.49 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486353  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.02 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  28.18 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  47.37 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  24.37 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.29 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  45.61 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 
216 aa  52.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  30.65 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  27.54 
 
 
462 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.68 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  37.68 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  26.96 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.85 
 
 
209 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
251 aa  49.3  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  28.43 
 
 
258 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  40.62 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  29.47 
 
 
248 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 
203 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2531  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.54 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  29 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  29.35 
 
 
253 aa  46.6  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.98 
 
 
222 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.98 
 
 
222 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  27.83 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  32.41 
 
 
121 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  39.74 
 
 
216 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
236 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>