131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1588 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 293 aa  609  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  53.71 
 
 		 298 aa  308  8e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  54.38 
 
 		 319 aa  308  9e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  45.49 
 
 		 291 aa  278  6e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  43.95 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  36.76 
 
 		 274 aa  169  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  37.65 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  33.94 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  33.94 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  36.49 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  35.66 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  35.65 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  33.21 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  34.8 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  31.27 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  36.24 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  34.78 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  32.17 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  26.34 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  28.14 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  26.27 
 
 		 286 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  24.82 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  29.32 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  28.95 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 279 aa  86.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  28.68 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  26.75 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  32.7 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  27.56 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  31.75 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  28.29 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  28.71 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  29.11 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  26.67 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  25.51 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  27.75 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  25.2 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  29.75 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  26.47 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  20.91 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  30.43 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  25.58 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  23.33 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.41 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  25.7 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  52.05 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  37.61 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  25.11 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  32.85 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  27.72 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  43.66 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  32.63 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  26.04 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.82 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  36.78 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2422  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  0.0203138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  42.25 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  45.59 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.39 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  36.49 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.38 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  40.85 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  54.35 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0313  putative methyltransferase  35.63 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.459942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  22.81 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  26.53 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  35.63 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  42.22 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  25.39 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  40.85 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  30.65 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  57.14 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  55.56 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  36 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  34.09 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 189 aa  45.8  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  52.63 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  43.94 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  35 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  38.03 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2023  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.16 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.88 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  38.03 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>