205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2275 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  37.77 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  32.14 
 
 
302 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  34.97 
 
 
283 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  33.68 
 
 
274 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  31.79 
 
 
283 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  30.82 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  35.69 
 
 
270 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  32.17 
 
 
278 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
279 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  34.2 
 
 
279 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
280 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.06 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  29.29 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  26.83 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  28.76 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  33.57 
 
 
279 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  31.8 
 
 
287 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  35.71 
 
 
269 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  33.62 
 
 
302 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  32.27 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  27.6 
 
 
273 aa  99  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  27.24 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  32.54 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
276 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  24.35 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.2 
 
 
352 aa  97.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  28.52 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  28.52 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  26.71 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  29.32 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  29.22 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  26.05 
 
 
286 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  32.46 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  30.97 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  29.03 
 
 
319 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  32.12 
 
 
254 aa  87  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  34.27 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  28.07 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.33 
 
 
291 aa  85.5  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  26.57 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  28.05 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  29.43 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  31.16 
 
 
254 aa  79  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  26.64 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  23.19 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  27.56 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  30.23 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  37.38 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  28.25 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  29.88 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  24.81 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  28.12 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  28.63 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  27.54 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  27.19 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  25.54 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  23.39 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  29.15 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25.73 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  23.44 
 
 
191 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  27.59 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  24.28 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  27.65 
 
 
241 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  27.93 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.04 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  25.47 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  37.33 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  34.58 
 
 
121 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
215 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
255 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  37.18 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  34.26 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  25 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  24.74 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  24.52 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.97 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1480  RNA methyltransferase, TrmA family  41.1 
 
 
442 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1832  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  23.01 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  28.76 
 
 
194 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  35.29 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  22.57 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0536  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  27.5 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>