91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0040 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  44 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  41.2 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  39.76 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  36.76 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  38.74 
 
 		 291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  32.21 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  34.7 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  35.84 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  32.47 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  35.14 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  35.11 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  33.74 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.44 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  28.63 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  36.77 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  31.73 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  30.09 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  30.52 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  30.74 
 
 		 283 aa  92  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  29.82 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  32.53 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  32.53 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.8 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  34.87 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  34.87 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  30.54 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  34.44 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  29.88 
 
 		 279 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  29.77 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  30.28 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  29.3 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.32 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  30.19 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  28.98 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  29.33 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  26.95 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  27.21 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  30.12 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  26.41 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  26.07 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  38.16 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  25.25 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  26.7 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  30.69 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  28.3 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  25.81 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  24.69 
 
 		 279 aa  52.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  26.01 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  25.48 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  26.72 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  28.22 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.93 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  35.53 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  25.44 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  36.84 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  31.03 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  36.84 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  34.67 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  33.64 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  23.78 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  28.48 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  30.67 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  34.67 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  41.07 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  28.97 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  25.21 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  34.67 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  34.67 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1527  hypothetical protein  29.03 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  36.21 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.53 
 
 		 352 aa  42.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.82 
 
 		 232 aa  42.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0601  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 236 aa  42  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  32 
 
 		 249 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>