103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3030 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  55.26 
 
 		 265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  32.03 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  31.41 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  31.15 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  34.09 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  34.23 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.61 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  30.64 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  25.58 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  28.18 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  30.04 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  24.33 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  25.9 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  28.51 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  24.62 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  27.19 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  37.1 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  26.99 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  29.09 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  32.11 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  24.03 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  31.37 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  28.57 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  30.11 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  28.04 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  25.1 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.65 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  25.3 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  32.61 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.68 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  25.52 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  31.13 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  27.51 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  28.11 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  23.77 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  22.98 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  23.51 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  24.86 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  23.51 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  33.65 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  27.61 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  26.16 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  34.58 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  26.51 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  26.29 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  23.77 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  26.28 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  46.55 
 
 		 217 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  27.34 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  24.89 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1230  methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0668757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.05 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  34.57 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  29 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.06 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  26.15 
 
 		 232 aa  49.3  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  25.19 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  24.14 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  30.57 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  29.06 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  25.2 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  36 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  26.43 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  26.88 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  34.25 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  23.96 
 
 		 191 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  23.04 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  25.82 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.05 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 188 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2409  hypothetical protein  41.67 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.452604  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  32.14 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  30.93 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  44.23 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.33 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>