244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0250 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  55.97 
 
 		 270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  34.85 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  35.52 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  35.68 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  35.04 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  36.1 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  33.33 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.49 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  33.09 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  30.11 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.82 
 
 		 352 aa  99  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  34.27 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.12 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  31.84 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  26.17 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  26.78 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  24.87 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  31.52 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  30.17 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  27.93 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  23.3 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  23 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.95 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  22.07 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  50.94 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  24.62 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  25.62 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.25 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  24.07 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  23.19 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  23.37 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  25.27 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  22.35 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  43.28 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.33 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  21.43 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  24.19 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  30.85 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  24.42 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  30.91 
 
 		 459 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  26.52 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  26.87 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  25.15 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  25.97 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  44.44 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  25.94 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  43.75 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  26.52 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  26.35 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  25.57 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  20.68 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  43.06 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  23.5 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  29.82 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  32.73 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  35.53 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  38.96 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.58 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  28.87 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  23.16 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  33.01 
 
 		 419 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  46.3 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  41.27 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  22.38 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  35.24 
 
 		 314 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  27.54 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  27.54 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.54 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  25.65 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.54 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1230  methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 180 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0668757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  36.76 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  44 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  44 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.47 
 
 		 444 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.13 
 
 		 464 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>