More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1791 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  100 
 
 
378 aa  737    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  54.5 
 
 
376 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  50.95 
 
 
368 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  52.56 
 
 
380 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  52.56 
 
 
380 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  52.3 
 
 
379 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  52.26 
 
 
358 aa  358  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  52.27 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  50.67 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  52.17 
 
 
374 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  51.51 
 
 
389 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  52.72 
 
 
425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  52.45 
 
 
378 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  52.45 
 
 
396 aa  349  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  52.45 
 
 
378 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  52.45 
 
 
378 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  52.45 
 
 
378 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  52.45 
 
 
378 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  48.96 
 
 
409 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  51.9 
 
 
374 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  52.99 
 
 
378 aa  345  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  48.22 
 
 
417 aa  339  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  52.04 
 
 
377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  51.5 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  48.75 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  50.95 
 
 
377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  50.68 
 
 
397 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  50.68 
 
 
397 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  50.68 
 
 
397 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  50.95 
 
 
377 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  44.27 
 
 
389 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  47.03 
 
 
384 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  47.44 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  49.47 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  46.61 
 
 
388 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  46.93 
 
 
425 aa  302  8.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  49.08 
 
 
390 aa  298  9e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  41.07 
 
 
400 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  46.65 
 
 
382 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  46.81 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  43.91 
 
 
404 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  46.03 
 
 
386 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  42.86 
 
 
404 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  41.21 
 
 
414 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  32.69 
 
 
208 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  35.98 
 
 
202 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  32.93 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  31.9 
 
 
202 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  32.12 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.63 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  31.33 
 
 
202 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.54 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  44.05 
 
 
89 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  39.86 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.05 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  32.54 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  31.65 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  32.59 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  36.05 
 
 
278 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  33.53 
 
 
226 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  36.65 
 
 
231 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  34.18 
 
 
202 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  41.51 
 
 
288 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  31.16 
 
 
238 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  34.87 
 
 
185 aa  63.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  32.48 
 
 
227 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  35.48 
 
 
188 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  29.8 
 
 
243 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  38.02 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.77 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.05 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  37.1 
 
 
208 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  40.54 
 
 
276 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  28.86 
 
 
276 aa  60.8  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.43 
 
 
367 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  31.82 
 
 
202 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  32.83 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  36.3 
 
 
249 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  35.86 
 
 
275 aa  59.7  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  39.09 
 
 
231 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  25.95 
 
 
201 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  26.9 
 
 
326 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  39.09 
 
 
231 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  40.15 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  26.19 
 
 
271 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  30.94 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  26.87 
 
 
262 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.62 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.07 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3777  hypothetical protein  32 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165446 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
256 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.54 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  37.93 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  38.27 
 
 
241 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  36.84 
 
 
239 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  36.03 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  29.93 
 
 
251 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  35.48 
 
 
289 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>