More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2705 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
238 aa  498  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  35.9 
 
 
235 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  40.41 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  37.86 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  38.46 
 
 
248 aa  151  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  36.93 
 
 
240 aa  148  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  35 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  35.42 
 
 
248 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  35.42 
 
 
252 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  35.42 
 
 
248 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  36.86 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  36.32 
 
 
240 aa  145  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  34.89 
 
 
245 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.89 
 
 
245 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  34.89 
 
 
245 aa  141  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  34.89 
 
 
245 aa  141  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  34.89 
 
 
245 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  34.89 
 
 
245 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  34.89 
 
 
245 aa  141  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  34.89 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  34.47 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  35.9 
 
 
248 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  36.55 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  34.89 
 
 
245 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  36.32 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  35.19 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  34.31 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  34.47 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  34.89 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  34.89 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  31.25 
 
 
243 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  34.31 
 
 
234 aa  128  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  33.96 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  31.97 
 
 
241 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  33.62 
 
 
238 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  33.62 
 
 
238 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  33.33 
 
 
253 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  31.6 
 
 
251 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  34.39 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  31.12 
 
 
244 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  31.4 
 
 
243 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  32.91 
 
 
238 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  31.33 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  32.2 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  33.76 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  31.51 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  34.39 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  30.21 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  31.68 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  29.43 
 
 
265 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  31.17 
 
 
255 aa  101  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  25.63 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  28.42 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.48 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  23.61 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  31.16 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  24.32 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  31.16 
 
 
378 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  24 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  24.52 
 
 
338 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  25.74 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  25.73 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  25.73 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  25.73 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  25.73 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  25.73 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  38.89 
 
 
400 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  28.69 
 
 
303 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  28.69 
 
 
303 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  25.15 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  25.15 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  25.73 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  25.16 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  23.53 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  22.28 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  25.13 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  26.88 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  25.32 
 
 
414 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  33.04 
 
 
286 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  25.73 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  25.15 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  23.97 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  29.93 
 
 
404 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.88 
 
 
322 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  30.16 
 
 
404 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.75 
 
 
330 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  25.5 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  25.5 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  27.46 
 
 
417 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  23.86 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0004  methyltransferase, HemK family  28.05 
 
 
290 aa  56.6  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  27.22 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  24.38 
 
 
211 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  25.27 
 
 
578 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  25.42 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  22.73 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  29.17 
 
 
368 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  31.76 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  31.9 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.02 
 
 
354 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>