194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0058 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  93.32 
 
 
404 aa  735    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  100 
 
 
404 aa  827    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  69.67 
 
 
400 aa  578  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  52.04 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  53.96 
 
 
376 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  52.69 
 
 
380 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  52.15 
 
 
374 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  52.69 
 
 
380 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  50.63 
 
 
381 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  50.87 
 
 
378 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  50.37 
 
 
378 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  50.5 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  50.89 
 
 
374 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  50.74 
 
 
417 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  49.75 
 
 
379 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  54.04 
 
 
390 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  50.37 
 
 
378 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  50.25 
 
 
396 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  50.62 
 
 
378 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  50.62 
 
 
378 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  51.96 
 
 
403 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  50.37 
 
 
378 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  47.74 
 
 
389 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  50.64 
 
 
384 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  51 
 
 
389 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  49.14 
 
 
409 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  50.51 
 
 
392 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  50.62 
 
 
417 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  52.53 
 
 
390 aa  364  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  50.12 
 
 
377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  49.88 
 
 
397 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  49.88 
 
 
397 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  49.38 
 
 
377 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  50.12 
 
 
377 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  49.13 
 
 
377 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  49.38 
 
 
397 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  48.99 
 
 
388 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  47 
 
 
425 aa  332  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  47.12 
 
 
358 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  43.91 
 
 
378 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  40.8 
 
 
414 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  41.28 
 
 
382 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  39.7 
 
 
382 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  39.65 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  57.83 
 
 
89 aa  98.6  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  27.81 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  27.27 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  27.93 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  26.2 
 
 
202 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  29.66 
 
 
227 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  29.93 
 
 
238 aa  59.7  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  31.17 
 
 
498 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  30.61 
 
 
277 aa  56.2  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  26.45 
 
 
208 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  35.07 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  29.35 
 
 
188 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  23.94 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0498  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.51 
 
 
298 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  39.02 
 
 
275 aa  51.2  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  32.8 
 
 
208 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  35.21 
 
 
286 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  36.43 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  33.12 
 
 
333 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  28.82 
 
 
288 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  29.49 
 
 
494 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  37.5 
 
 
280 aa  50.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  30 
 
 
278 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  28.1 
 
 
185 aa  50.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.7 
 
 
280 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.51 
 
 
286 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  37.5 
 
 
280 aa  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  30.41 
 
 
509 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  36.46 
 
 
286 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  28.09 
 
 
341 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  30.67 
 
 
394 aa  49.7  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.71 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  32.73 
 
 
286 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  36.46 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  28.26 
 
 
340 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  29.51 
 
 
177 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  36.46 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  28.79 
 
 
241 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  31.31 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  31.93 
 
 
215 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  27.21 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.17 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  38.54 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  33.93 
 
 
285 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  34.31 
 
 
280 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  30.16 
 
 
185 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  32.73 
 
 
196 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  30.14 
 
 
490 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  25.35 
 
 
199 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  31.4 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  22.15 
 
 
199 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1460  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.12 
 
 
298 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  33.86 
 
 
484 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.81 
 
 
276 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  25.97 
 
 
196 aa  47.4  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  25.35 
 
 
199 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>