More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0496 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  95.23 
 
 		 377 aa  695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  94.43 
 
 		 377 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  95.49 
 
 		 377 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  98.24 
 
 		 397 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  100 
 
 		 397 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  95.49 
 
 		 377 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  100 
 
 		 397 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  80.99 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  81.75 
 
 		 378 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  81.48 
 
 		 378 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  79.75 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  81.48 
 
 		 378 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  81.48 
 
 		 378 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  81.22 
 
 		 378 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  81.7 
 
 		 378 aa  607  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  76.66 
 
 		 376 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  75.07 
 
 		 380 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  75.07 
 
 		 380 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  74.54 
 
 		 389 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  72.58 
 
 		 381 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  72.15 
 
 		 374 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  72.41 
 
 		 374 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  71.65 
 
 		 379 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  68.98 
 
 		 392 aa  502  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  64.59 
 
 		 368 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  64.76 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  63.57 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  64.51 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  58.29 
 
 		 389 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  67.44 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  63.52 
 
 		 384 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  63.03 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  65.62 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  65.1 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  56.82 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  60.22 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  50.64 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  50.63 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  50.37 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  50.68 
 
 		 378 aa  332  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  53.37 
 
 		 382 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  53.24 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  52.88 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  46.6 
 
 		 414 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  60.47 
 
 		 89 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  34.51 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.59 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  33.5 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  36.22 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  39.86 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  29.09 
 
 		 262 aa  57  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  40 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  37.5 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1910  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.03 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  40 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  40 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  31.94 
 
 		 522 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  37.18 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1942  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.23 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  36.28 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  32.95 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  30.92 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  33.77 
 
 		 287 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  31.07 
 
 		 278 aa  54.7  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  32.87 
 
 		 293 aa  54.3  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.87 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  38.22 
 
 		 307 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.02 
 
 		 286 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  32.39 
 
 		 280 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 285 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.39 
 
 		 318 aa  53.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  39.22 
 
 		 292 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.68 
 
 		 287 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  38.89 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.74 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0498  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.78 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1460  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.24 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.5 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.12 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  35 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  34.86 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  35.11 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  34.97 
 
 		 490 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.09 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  36.72 
 
 		 345 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  23 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  28.57 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  25.21 
 
 		 208 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  26.51 
 
 		 238 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  32.76 
 
 		 484 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  30.64 
 
 		 496 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1456  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.18 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000347757  normal  0.132252 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  23 
 
 		 202 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.58 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  26.92 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  34.23 
 
 		 295 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  34.59 
 
 		 276 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  33.85 
 
 		 282 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  34.62 
 
 		 282 aa  50.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>