More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2638 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2638  methyltransferase small  100 
 
 		 409 aa  830    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  67.85 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3426  methyltransferase small  66.34 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3599  methyltransferase small  67.26 
 
 		 380 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4676  methyltransferase small  67.26 
 
 		 380 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2738  methyltransferase small  67.01 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3159  hypothetical protein  65.89 
 
 		 376 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2811  hypothetical protein  65.63 
 
 		 378 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3618  methyltransferase small domain-containing protein  65.89 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1732  hypothetical protein  65.63 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3631  putative methyltransferase  65.89 
 
 		 378 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0034  hypothetical protein  65.63 
 
 		 378 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3606  putative methyltransferase  65.89 
 
 		 378 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3166  putative methyltransferase  65.63 
 
 		 378 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3539  methyltransferase small  65.03 
 
 		 374 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332123  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2699  methyltransferase small:ribosomal L11 methyltransferase  63.14 
 
 		 381 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0419  hypothetical protein  64.25 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2943  hypothetical protein  65.37 
 
 		 378 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0469  methyltransferase small  64.6 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  63.43 
 
 		 379 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2124  methyltransferase small  62.56 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.067478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2609  methyltransferase small  64.51 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0401  methyltransferase small  65.12 
 
 		 377 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0496  methyltransferase small  64.51 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0427  methyltransferase small  64.86 
 
 		 377 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648824  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3584  methyltransferase  64.08 
 
 		 377 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.781513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2901  methyltransferase small  63.57 
 
 		 377 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.551827  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1253  methyltransferase small  63.61 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1722  methyltransferase small  59.11 
 
 		 368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0488  methyltransferase small  59.49 
 
 		 389 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.212986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0519  methyltransferase small  57.4 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2545  methyltransferase small  62.09 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.313856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3193  methyltransferase small  62.76 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455241 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1562  methyltransferase small  59.22 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5203  methyltransferase small  55.19 
 
 		 403 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1101  methyltransferase small  51.72 
 
 		 400 aa  391  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0966  methyltransferase small  54.69 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  48.96 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0053  hypothetical protein  50 
 
 		 404 aa  343  4e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0058  methyltransferase small  49.14 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.520112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  48.22 
 
 		 382 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  48.73 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  47.56 
 
 		 386 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  43.69 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1322  methyltransferase small  60.71 
 
 		 89 aa  106  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000042081  hitchhiker  1.71199e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  32.24 
 
 		 227 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  26.9 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  33.78 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  29.46 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  29.58 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  37.08 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.31 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  35 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  35.05 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  27.34 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  33.83 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.25 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  28.97 
 
 		 262 aa  57  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  32.28 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0545  methyltransferase small  33.16 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  36.44 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  32.65 
 
 		 185 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  26.77 
 
 		 202 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  34.48 
 
 		 578 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  30.71 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.93 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2340  methyltransferase small  33.16 
 
 		 333 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.271786 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.44 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  36 
 
 		 208 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.35 
 
 		 293 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.8 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  42.11 
 
 		 276 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  25.9 
 
 		 202 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.03 
 
 		 313 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0685  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.65 
 
 		 333 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.59 
 
 		 315 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  35.77 
 
 		 278 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  32.52 
 
 		 297 aa  53.5  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.06 
 
 		 718 aa  53.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  34.07 
 
 		 231 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36300  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  44 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  27.61 
 
 		 238 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.08 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.23 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.65 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  29.73 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  46.75 
 
 		 289 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.63 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.23 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  31.88 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  42.31 
 
 		 288 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  28.87 
 
 		 177 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.23 
 
 		 306 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.53 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.32 
 
 		 295 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  32.67 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  30.71 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.31 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1943  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  28.67 
 
 		 299 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.858484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>