More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0030 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0030  methylase  100 
 
 
177 aa  357  4e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  39.11 
 
 
202 aa  97.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  31.91 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  37.43 
 
 
202 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  36.13 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  36.94 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  36.31 
 
 
202 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  37.3 
 
 
202 aa  89  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  34.9 
 
 
227 aa  84.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  28.96 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  35.36 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  39.53 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  29.95 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  35.29 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  30.16 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  33.6 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  28.48 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  30 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  32.32 
 
 
277 aa  70.9  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  25.54 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  26.52 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  30.82 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  32.65 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  32.17 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  26.34 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  32.28 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  30.77 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  31.65 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  33.9 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  34.68 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  32.35 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.33 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  48.65 
 
 
258 aa  64.7  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  26.4 
 
 
208 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  31.86 
 
 
536 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  32.91 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  44.3 
 
 
276 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  33.33 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  36.05 
 
 
283 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  26.84 
 
 
235 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  33.86 
 
 
288 aa  59.3  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  44.59 
 
 
247 aa  59.3  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  38.36 
 
 
333 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.53 
 
 
304 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  39.74 
 
 
293 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  30.82 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  33.33 
 
 
199 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  31.33 
 
 
304 aa  58.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  29.31 
 
 
207 aa  58.2  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  29.01 
 
 
275 aa  58.2  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1247  methylase of polypeptide chain release factor  28.95 
 
 
280 aa  58.2  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  29.26 
 
 
223 aa  57.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  32.73 
 
 
317 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  29.27 
 
 
340 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.57 
 
 
342 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  39.29 
 
 
288 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  29.27 
 
 
341 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  34.17 
 
 
235 aa  57.4  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  27.64 
 
 
324 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  31.3 
 
 
288 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.4 
 
 
277 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.8 
 
 
310 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2594  modification methylase, HemK family  35.71 
 
 
310 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.57 
 
 
342 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.57 
 
 
342 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  28.87 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  34.09 
 
 
280 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2812  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.07 
 
 
310 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.57 
 
 
342 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.57 
 
 
342 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  40 
 
 
262 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  28.09 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  31.97 
 
 
280 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.36 
 
 
288 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  29.31 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  33.71 
 
 
264 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1017  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.83 
 
 
303 aa  55.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.78 
 
 
297 aa  55.1  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  39.47 
 
 
281 aa  55.1  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  30.83 
 
 
199 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  36.9 
 
 
285 aa  55.1  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 
276 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 
276 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  34.41 
 
 
279 aa  55.1  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  30.63 
 
 
315 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.06 
 
 
306 aa  54.7  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  33.71 
 
 
264 aa  54.7  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  23.53 
 
 
232 aa  54.3  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.85 
 
 
343 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  28.46 
 
 
341 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  32.03 
 
 
307 aa  54.3  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3375  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.07 
 
 
324 aa  54.3  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.85 
 
 
343 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  25.85 
 
 
343 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.85 
 
 
343 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  25.85 
 
 
343 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1540  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.19 
 
 
309 aa  54.3  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  31.67 
 
 
261 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.83 
 
 
286 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  30.72 
 
 
287 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>