More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1039 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  76.52 
 
 
235 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  58.44 
 
 
231 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  58.01 
 
 
231 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  58.01 
 
 
231 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  50.45 
 
 
249 aa  175  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  49.53 
 
 
223 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2307  methylase  50 
 
 
218 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000535165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  41.51 
 
 
218 aa  141  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  42.65 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  43.66 
 
 
236 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  40.28 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  31.72 
 
 
208 aa  94  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  34.29 
 
 
202 aa  88.6  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  35.42 
 
 
204 aa  88.2  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  32.57 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  32.04 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  32.57 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  36.87 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  29.9 
 
 
177 aa  77.8  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  35.29 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.71 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  31.68 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  34.71 
 
 
286 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  34.27 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  27.6 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  32.89 
 
 
284 aa  72  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.18 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  36.53 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  34.62 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  33.33 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.61 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  33.52 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  32.58 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  36.42 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  31.66 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  38.46 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.12 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03531  putative protein methyltransferase  28.34 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.854566  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  32.28 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.44 
 
 
288 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  34.83 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  41.13 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  30.2 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.1 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0476  HemK family modification methylase  30.98 
 
 
301 aa  65.1  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540191  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  28.57 
 
 
279 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34.38 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.84 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  32.54 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  27.13 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03115  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.43 
 
 
310 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002862  hypothetical adenine-specific methylase yfcB  35.43 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  34.21 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1700  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.22 
 
 
314 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  34.19 
 
 
277 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  34.3 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4934  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.93 
 
 
299 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  31.43 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  27.78 
 
 
285 aa  62  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2308  HemK family modification methylase  30.17 
 
 
289 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  31.46 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1344  modification methylase, HemK family  36.43 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  34.19 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  33.14 
 
 
287 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  25.49 
 
 
277 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  34.81 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3872  HemK family modification methylase  32.95 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1858  modification methylase HemK  30.56 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3886  HemK family modification methylase  32.95 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  32.26 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3960  HemK family modification methylase  32.95 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  0.293002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  33.71 
 
 
280 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.55 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  31.13 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1157  HemK family modification methylase  28.42 
 
 
308 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.198451  normal  0.0970281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  27.14 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  32.34 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  34.23 
 
 
283 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  33.33 
 
 
276 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.94 
 
 
296 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
276 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  30.46 
 
 
286 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  35.29 
 
 
336 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  31.79 
 
 
280 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  25.74 
 
 
285 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.92 
 
 
299 aa  58.5  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  25.49 
 
 
277 aa  58.9  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  29.14 
 
 
286 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  31.18 
 
 
294 aa  58.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04091  putative protein methyltransferase  28.49 
 
 
273 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4971  protein-(glutamine-N5) methyltransferase  30.77 
 
 
299 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0361439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08080  putative methylase of HemK family  33.64 
 
 
300 aa  57.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  28.65 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1546  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.09 
 
 
310 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2167  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
314 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  29.94 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  29.14 
 
 
286 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  29.14 
 
 
286 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>