More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3235 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  100 
 
 		 202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  57.92 
 
 		 202 aa  222  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  47.83 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  47.54 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  45.99 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  46.96 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  44.95 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  46.89 
 
 		 193 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  40.76 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  43.68 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  42.63 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  42.93 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  39.56 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  42.58 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  43.42 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  42.62 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  36 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  38.25 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  31.47 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  30.77 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  31.55 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  29.73 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  30.43 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5791  putative methylase  29.84 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  27.51 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  30.16 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  31.9 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  31.55 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  31.55 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5532  predicted protein  27.68 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  28.57 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  33.07 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  31.91 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  31.98 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  31.03 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  29.21 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  31.9 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  30.99 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  27.57 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  29.63 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  28.87 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  31.47 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3777  hypothetical protein  29.37 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  34.18 
 
 		 378 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  32.95 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  30.86 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  33.56 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  30.05 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1039  putative methylase  27.6 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  30.07 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04120  conserved hypothetical protein  36.61 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  32.5 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  27.71 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  28.12 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  31.17 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1301  methyltransferase small  30.64 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  29.89 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  30.38 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  29.38 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  32.04 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  30.98 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0498  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.25 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  27.37 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1460  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.54 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  32.54 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  33.1 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  29.03 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  31.97 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  31.97 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2467  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.89 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.466168  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  31.97 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  28.28 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  29.8 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  29.38 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.12 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  31.94 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.12 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  32.41 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  31.34 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  30.93 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  30.14 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  26.56 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.58 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  27.37 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  32.03 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  27.37 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  26.32 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  26.79 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.45 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  26.56 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.37 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  26.56 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02104  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.563309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  27.37 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  30.4 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  26.32 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  32.21 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  29.53 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  26.04 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  27.37 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>