34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5532 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_5532  predicted protein  100 
 
 
238 aa  492  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  32.75 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  29.67 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02104  conserved hypothetical protein  30.08 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.563309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  27.68 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04120  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  31.72 
 
 
185 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  27.87 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  28.49 
 
 
193 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  27.06 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  28.06 
 
 
202 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  27.27 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  31.89 
 
 
188 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  25.79 
 
 
185 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  26.89 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  26.34 
 
 
202 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.19 
 
 
287 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  25.85 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  29.95 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  26.74 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  28.88 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  27.03 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  29.31 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  27.17 
 
 
179 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  34.21 
 
 
345 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  30.17 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  28.22 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  24.81 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  28.07 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  29.06 
 
 
273 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  29.19 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  25.35 
 
 
285 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  29.2 
 
 
340 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  31.25 
 
 
284 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>