More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0551 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0551  methylase  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  61.02 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  59.66 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3030  putative methylase  52.76 
 
 		 164 aa  167  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  51.96 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  46.96 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  49.73 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  52.81 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1092  methylase  46.27 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2106  methylase  50.28 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0682374  normal  0.0494435 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2394  methylase  49.45 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0901  putative methylase  45.56 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0037483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  44.44 
 
 		 204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  36.02 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  39.39 
 
 		 202 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  38.18 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  38.18 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  39.16 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  27.81 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  32.47 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  35.29 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  35.12 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53410  predicted protein  27.6 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  38.15 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  32.93 
 
 		 275 aa  64.7  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  32.58 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32 
 
 		 289 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5220  putative methylase  32 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893097 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.94 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17444  predicted protein  30.19 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.530661  normal  0.176894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  31.49 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.81 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  27.22 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  26.74 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  33.93 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  40.32 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.71 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  31.82 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  34.75 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  32.39 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.82 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  32.43 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  31.37 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  34.68 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  29.93 
 
 		 262 aa  57  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.5 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4295  methylase  36.18 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  35.78 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1990  modification methylase, HemK family  32.26 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  29.71 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  34.92 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.76 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  35.71 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  32.74 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  28.48 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  29.48 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  32.21 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.19 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3613  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 325 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.283182  normal  0.0446464 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  25.9 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  33.7 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  36.36 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11400  HemK-related putative methylase  36.59 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  31.51 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.5 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4634  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.24 
 
 		 320 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  34.09 
 
 		 336 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4852  putative methylase  37.17 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  28.18 
 
 		 286 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  28.18 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  36.07 
 
 		 317 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  28.18 
 
 		 286 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4941  putative methylase  37.17 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.485322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4817  modification methylase, HemK family  32.04 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  30.64 
 
 		 280 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  30.82 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  34.21 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  29.52 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  28.49 
 
 		 279 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.55 
 
 		 276 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.13 
 
 		 283 aa  51.6  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  28.96 
 
 		 284 aa  51.6  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.16 
 
 		 288 aa  51.6  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  32.2 
 
 		 299 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  27.13 
 
 		 283 aa  51.6  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  32.93 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1918  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  26.47 
 
 		 361 aa  51.2  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1890  modification methylase, HemK family  33.12 
 
 		 345 aa  51.2  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000215054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  26.8 
 
 		 302 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  37.8 
 
 		 324 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  33.12 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  29.32 
 
 		 315 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  33.86 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  33.74 
 
 		 293 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  28.26 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  32.41 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  37.23 
 
 		 376 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  31.87 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6637  methylase  37.42 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0823855 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  25.29 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>